群体遗传学与精密切割肾组织切片相遇:在 BXD 小鼠联盟创始品系中对离体肾毒性进行建模

root 提交于 周一, 06/22/2026 - 20:47
急性肾损伤(AKI)每年影响数百万患者,并与较高的发病率和死亡率相关,迄今仍无治愈性治疗。药物诱导的肾毒性可占 AKI 病例的高达 25%,但个体易感性仍然难以预测。尽管推测遗传因素在这种变异性中发挥作用,但肾毒物诱导肾损伤的药物基因组学在很大程度上仍属未知。为研究由遗传决定的易感性,我们采用了来自 BXD 小鼠联盟两种创始品系 C57BL/6J 和 DBA/2J 的精密切割肾切片(PCKS)。PCKS 可保留组织结构和细胞间相互作用,在维持肾脏微环境的同时,允许对实验进行精确控制。将切片分别暴露于环孢素 A(80 nM,6 h;20 nM,24 h 和 48 h)和庆大霉素(1 M,6 h 和 24 h),以及正常氧条件(4°C,20 h)和高氧条件(4°C,20 h,并在培养箱中 4 h)。随后通过组织病理学评分、TUNEL 染色、ATP 定量和批量 RNA 测序对切片进行分析。我们发现,主要的变异来源是实验持续时间。尽管如此,在环孢素 A 和庆大霉素处理条件下,仍可观察到两种品系之间的细微差异,其中 DBA/2J 对肾毒性应激的反应更强,表现为 ATP 水平更低、凋亡细胞比例更高以及更显著的转录组反应。对于两种品系而言,正常氧条件是危害最小的处理条件。这些发现支持 BXD 创始品系在对肾毒性肾损伤的易感性方面存在差异的假说,并支持将 PCKS 作为研究早期肾脏应激反应的相关离体模型。该研究为将这一方法扩展至更广泛的 BXD 群体、以识别参与肾毒物遗传易感性的遗传位点和候选基因奠定了基础。

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