地中海同域栖息的虾虎鱼类群体中,连通性的平行性与基因组分化并存,但种群统计历史存在异质性

root 提交于 周日, 06/21/2026 - 02:47
理解海洋连通性能在多大程度上可由共享的海洋学和生物地理条件来预测,仍然是海洋生态学与进化研究中的核心挑战。对同域物种进行比较分析,为检验共同环境背景是否会产生可重复的种群结构与连通性模式,以及这种一致性是否也会在基因组层面展开,提供了一个强有力的框架。本文针对地中海特有的粘鱼属(Gouania)研究了这一问题。该类群为隐栖底栖的砾石海滩特化类群,成体活动能力有限,且具有较短的浮游幼体期。我们结合了两个分布重叠的东地中海物种(G. orientalis 和 G. hofrichteri)在克里特岛和基西拉岛周边的全基因组重测序数据、拉格朗日粒子漂移模拟、涵盖全部五个 Gouania 物种的线粒体系统地理分析,以及利用 MSMC2 进行的人口统计学重建。 被动漂移模拟预测,基西拉岛具有很强的隔离性,而克里特岛北部与南部之间的交流受到限制。这些预测与两个物种的全基因组种群结构高度吻合,尽管它们具有彼此独立的进化历史,却揭示出高度一致的连通性模式。此外,共享的种群分化对比还表现出显著过量的平行基因组分化,表现为基因组窗口和候选基因的重叠频率均高于随机预期。然而,大多数分化的基因组区域仍然是物种特异的,功能富集分析也未发现占主导地位的共享通路,这表明分化在很大程度上具有多基因基础。 与当代连通性和基因组分化所表现出的高度一致性相反,线粒体系统地理格局和物种层面的人口统计历史在整个属内则表现出显著更高的异质性。综合来看,我们的结果表明,海洋种群结构的可预测性具有尺度依赖性:共享的海洋景观能够产生可重复的连通性模式以及部分平行的基因组分化,而更深层次的系统地理和人口统计历史则仍然强烈受到物种特异性历史过程的影响。

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