血管空间分析（VeSpA）：一种用于全视野切片图像分割、形态测量及 QuPath 扩展的工具

在组织学全切片图像中对血管结构进行量化，对于研究组织构成、肿瘤微环境生物学以及疾病相关的血管重塑是必要的。然而，在常规免疫组织化学中进行血管分析仍然具有挑战性。现有工作流程通常依赖手工操作、需要编程专业知识，或缺乏与数字病理平台的直接集成。 我们开发了 VeSpA（Vessel Spatial Analysis，血管空间分析），这是一个用于在 CD31 染色全切片图像中自动进行血管分割和形态计量量化的开源流程与 QuPath 扩展。VeSpA 将可配置的信号提取与后续处理相结合：默认使用 CMYK 黄色通道提取，并可针对 H-DAB 图像选择 DAB 染色分解；同时结合自动或基于百分位数的阈值分割、形态学优化、轮廓过滤和管腔填充，从标准 DAB 染色切片中生成血管掩膜。 该 QuPath 扩展包含图形界面，可用于选择标注区域、TMA 芯或整张图像，配置分割参数，运行 Python 后端，并将血管对象直接导入 QuPath 层级结构中。对于每一个检测到的血管，VeSpA 可提取面积、长轴长度、短轴长度、偏心率、质心和方向，同时还可将汇总测量结果附加到父级标注区域和 TMA 芯上。 与独立病理学家标注的验证结果表明，VeSpA 的分割性能接近观察者间一致性水平，并且在测试数据集的基于重叠的评价指标上优于基于黄色通道提示的 SAM 以及零样本 YOLOv8-seg。VeSpA 将血管分割、形态计量特征提取和基于 QuPath 的可视化整合到单一的可复现工作流程中，可用于计算病理学中的血管定量以及组织学组织结构的空间分析。

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