SAbDab2:机器学习时代的抗体结构数据库

root 提交于 周日, 06/21/2026 - 18:47
结构抗体数据库(SAbDab)是一个公开可用的、收录实验测定抗体结构的资源库,最初于2013年发布。2021年,SAbDab 通过 SAbDab-nano 明确增加了对单域抗体的支持。近年来,随着人们对抗体兴趣的不断增长,新型抗体格式大量涌现;与此同时,机器学习的进步也提升了对标准化、高质量结构数据的需求。在此,我们提出面向机器学习时代重新构建的 SAbDab2。它引入了对多种新格式的支持,并使用户能够轻松检索和比较某一特定抗体的所有已知结构。 此外,SAbDab2 还为适用于机器学习的抗体结构及抗体–抗原复合物结构提供了便捷访问,并附带标准化、带版本管理的训练/测试数据划分。今后这些数据将每六个月更新一次,并可在 https://zenodo.org/records/20083995 获取。SAbDab2 本身每周更新一次,并可通过 https://sabdab2.opig.stats.ox.ac.uk 免费访问。

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