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核磁共振(NMR)弛豫实验为跨越广泛时间尺度的生物分子动力学研究提供了强有力的、可在残基分辨率上展开的观测手段。不幸的是,弛豫数据的定量分析目前仍分散于各种专门化且往往彼此割裂的工具之中。在此,我们介绍 CcpNmr AnalysisDynamics,这是 CcpNmr Analysis 程序套件的最新组成部分,提供了一个用于弛豫分析、考虑交换效应的结果解释以及动力学建模的集成框架。该平台在可复现的工作流程中统一了弛豫速率提取、诊断性验证、基于模型的分析以及结构可视化,同时通过稳健的应用程序编程接口和插件架构支持未来扩展。我们还引入了 ModelAnalysis(ModA),这是一种基于 Lipari-Szabo 形式主义的新分析引擎,集成了面向异质性弛豫数据集设计的稳健优化、不确定性估计和模型选择策略。该框架还支持以交换过程为重点的分析,并可与专门的外部建模工具集成,使弛豫异常能够从初始检测一路追踪到更为深入的解释。AnalysisDynamics 的适用性和可靠性通过对来自 Biological Magnetic Resonance Data Bank 的精选弛豫数据集进行系统性的重新分析与验证而得到展示。这些分析能够评估跨磁场条件下的数据一致性、动力学参数和模型可靠性,从而为从 NMR 弛豫测量到与结构关联的生物分子动力学解释提供一条可复现的路径。
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📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.19.733360v1?rss=1
🏷️ 核磁共振 弛豫数据分析 生物分子动力学 动力学建模 结构可视化 可复现工作流
来源出处
CcpNmr AnalysisDynamics:用于核磁共振动力学数据分析的统一框架
https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.19.733360v1?rss=1