种群特异性的选择性扫荡促进了莱茵衣藻遗传结构的维持

微生物真核生物通常表现出较大的有效种群规模和广泛的扩散能力，然而，其种群结构的程度及塑造这种结构的作用力仍然知之甚少。尽管生物地理结构常被归因于扩散受限，但自然选择在维持分化中的作用却较少受到关注。我们研究了世界性分布的土壤藻类莱茵衣藻（Chlamydomonas reinhardtii）的种群结构与适应性进化。除已有的35个北美基因组序列外，我们还对来自加拿大安大略省的38个新分离株进行了测序。种群遗传结构分析表明，这些来自安大略省的新分离株构成了第二个采样充分且在遗传上彼此独特的簇，并且这种结构在近期迁移个体存在的情况下仍然持续存在。利用该数据集，我们得以在全物种范围内以及各个种群内部开展全基因组水平的选择性清除扫描。我们的结果保守地鉴定出151个物种范围的清除事件和325个种群特异性信号，表明正选择广泛存在且十分常见。两个不同遗传簇的持续存在以及受到差异选择作用的位点，共同证明了尽管持续存在基因流，局部适应仍得以维持。总体而言，我们的结果表明，在这种高扩散能力的微生物中，选择在强化地理结构方面发挥着核心作用。

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