检测提示X染色体失活可变逃逸的DNA甲基化模式

X染色体常常被排除在分析性状与DNA甲基化关联的研究之外。在女性中，X染色体上大多数基因的一份拷贝会因失活X染色体上的基因启动子发生DNA甲基化而被沉默（X染色体失活；XCI）。这给DNA甲基化数据模式的分析与解释带来了挑战。尤其对于存在性别偏倚的疾病和性状而言，X染色体上可能存在许多值得关注的位点，而X染色体约占基因组的5%。为满足对X染色体上DNA甲基化数据进行适当分析的需求，我们开发了一种统计学方法，用于推断对表型或协变量取值敏感的位点特异性XCI逃逸。该方法的性能通过对两种具有性别偏倚的性状数据的分析得以展示：类风湿关节炎在女性中的发生率约为男性的3倍，而复发性静脉血栓栓塞在男性中的发生率约为女性的2.5倍。对这两个数据集的分析鉴定出X染色体上新的性状相关位点，展示了该新方法在重亚硫酸盐测序数据和Illumina EPIC数据中的适用能力，提示至少存在一个位点，其可变逃逸可能解释一种性别特异性的疾病关联，并排除了其他位点中可变逃逸作为潜在解释的可能性。

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🏷️ DNA甲基化 X染色体失活 XCI逃逸 表观遗传学 统计方法 性别偏倚疾病