二十面体病毒结构中对氯具有反应性的氨基酸残基的溶剂可及性：一项荟萃分析

游离氯会与病毒蛋白发生反应，但决定病毒对氯处理抗性的蛋白质结构因素仍知之甚少。在本研究中，我们从蛋白质数据库（Protein Data Bank）中整理了一个包含498个二十面体病毒结构的数据集，其中包括完整病毒粒子和类病毒颗粒（virus-like particles, VLPs）。令人惊讶的是，这些结构中仅有6.6%与已发表的病毒氯灭活速率常数（kobs）相关联。在这些匹配案例中，涉及12个病毒科，病毒附着与入侵蛋白中蛋氨酸残基的总溶剂可及表面积（solvent accessible surface area, SASA）和最大SASA可解释中位数kobs变异的78%，这表明蛋氨酸暴露在病毒抗性中起关键作用。 对于所有整理得到的结构，基于7种可与氯反应的残基的总SASA和最大SASA特征谱进行模糊C均值聚类表明，常用替代病毒面板（MS2、PhiX174、Phi6、PRD1和PR772）未能代表人类病毒的SASA多样性。相反，由于其SASA特征谱与人类病毒相似，VLP和新型无尾噬菌体可能作为氯处理更优的替代模型。我们的研究结果强调，残基的SASA特征为筛查病毒对氯的抗性提供了定量基线，并为未来消毒研究中识别在结构上更具代表性的病毒替代模型提供了一种数据驱动策略。

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