古代基因混合促进了亚洲叶猴的同倍体杂交物种形成和强烈的基因组侵蚀

古老的基因混合是进化创新的强大催化剂，然而，其对新形成谱系的长期基因组后果仍然知之甚少。在此，我们利用亚洲叶猴属（Trachypithecus）19个物种的53个全基因组数据，探讨古老基因混合在塑造网状辐射演化中的作用。我们将系统发育分析锚定于X连锁重组荒漠区（XLRD）；与常染色体相比，该区域中的基因渗入减少了84.5%，从而减轻了全基因组历史噪声的干扰，解析出真实的祖先物种树。基于全基因组的系统基因组学三元拓扑分析表明，这一辐射演化过程中系统发育不一致的主要驱动力是广泛存在的基因渗入，而非不完全谱系排序，确立了网状演化是塑造基因组多样性的主导力量。在这一网络中，我们鉴定出德拉库尔叶猴是同倍体杂交成种的一个明确案例，其起源于古老基因混合，基因组中约有30:70分别来自北方和南方祖先石灰岩叶猴谱系。这一杂交谱系似乎固定了与生殖隔离相关的关键位点，其中包括一个嵌合型RNF175等位基因，可能决定其具有诊断意义的被毛表型，说明渗入的遗传变异如何支撑快速的表型分化。然而，此后喀斯特破碎景观中的空间隔离迫使大量遗传负担转化为实际负荷。在属的范围内，纯合失功能变异超过82%，这与致死性隐性突变在长片段纯合区间中得以表达的情况一致。综上，我们的研究表明，古老基因混合既能同时触发同倍体杂交成种，也会将衍生谱系锁定在严重且长期的基因组退化之中，揭示了网状辐射演化核心中的一种根本性权衡。

本网站正在使用一项安全服务来保护自身免受在线攻击。您刚刚执行的操作触发了该安全解决方案。可能触发此拦截的行为包括提交某个特定单词或短语、SQL 命令或格式错误的数据。

您可以向网站所有者发送电子邮件，告知您被拦截的情况。请在邮件中说明本页面出现时您正在进行的操作，并附上本页面底部显示的 Cloudflare Ray ID。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.17.732823v1?rss=1

🏷️ 古代基因混合 同倍体杂交成种 基因渗入 系统基因组学 基因组侵蚀 叶猴进化