- 5 次围观
包装肉类的微生物腐败由复杂的微生物演替及其相关代谢活动所驱动，然而传统的保质期评估主要基于依赖培养和感官分析的保质期研究。在常规质量保证中，结果通常是回顾性获得的，并且仅与导致感官劣变的相关代谢活动存在间接联系。目前仍缺乏能够捕捉腐败微生物组活跃代谢状态并预测腐败速率的、具有功能性和时间信息的研究方法。 我们开发了一种考虑删失的高斯过程（censoring-aware Gaussian process, CAGP）框架，用于对采自连续贮藏天数、贮藏温度为4或6{degrees}C的肉鸡肉样品宏转录组数据中的纵向通路表达谱进行建模。样品依据基于气味的感官评分进行标注，定义为新鲜、早期腐败和晚期腐败阶段。由于通路水平数据中的观测零值可能反映的是未检出而非真实不存在，该模型将低值视为低于检测阈值的左删失观测，同时在估计平滑时间轨迹时纳入不确定性。 在4{degrees}C时间序列内进行留一预测时，预测采样日与真实采样日之间的平均差异为0.43天，且预测的腐败阶段与感官分类一致。在4{degrees}C条件下学习得到的轨迹还能够迁移到独立的6{degrees}C时间序列，并在腐败阶段层面保持有效，这表明尽管温度依赖性的腐败速率发生变化，共享的功能性腐败程序仍得以保留。进一步地，交叉熵排序识别出在不同温度条件下携带时间信息和阶段信息信号的通路模块。 总体而言，该框架为将宏转录组功能动态与感官腐败进程联系起来提供了一种概率性方法，从而为超越回顾性微生物计数的保质期评估提供支持。
冷藏温度下，与腐败相关的肉鸡肉腐败微生物组纵向宏转录组的贝叶斯建模显示出共享的预测特征标志 | bioRxiv
跳转至主要内容 首页 关于 投稿 提醒 / RSS 搜索此关键词 高级搜索 新结果
冷藏温度下，与腐败相关的肉鸡肉腐败微生物组纵向宏转录组的贝叶斯建模显示出共享的预测特征标志
Elio Nushi，Julia Manninen，Per Johansson，Antti Honkela，Johanna Björkroth
doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.11.731636
Elio Nushi 1 赫尔辛基大学； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY-ND 4.0 国际许可协议公开提供。
返回顶部 上一页 下一页
发布于 2026 年 6 月 18 日。
下载 PDF 电子邮件
感谢您帮助传播 bioRxiv。
您的电子邮件 * 您的姓名 * 发送至 * 请输入多个地址，每行一个，或用逗号分隔。
您将通过电子邮件发送以下内容： 冷藏温度下，与腐败相关的肉鸡肉腐败微生物组纵向宏转录组的贝叶斯建模显示出共享的预测特征标志
消息主题 （您的姓名）已从 bioRxiv 向您转发一个页面
消息正文 （您的姓名）认为您可能希望查看 bioRxiv 网站上的此页面。
您的个人留言
验证码
此问题用于测试您是否为人类访客，并防止自动垃圾信息提交。
分享
冷藏温度下，与腐败相关的肉鸡肉腐败微生物组纵向宏转录组的贝叶斯建模显示出共享的预测特征标志 Elio Nushi，Julia Manninen，Per Johansson，Antti Honkela，Johanna Björkroth bioRxiv 2026.06.11.731636； doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.11.731636
分享本文： 复制
引文工具
冷藏温度下，与腐败相关的肉鸡肉腐败微生物组纵向宏转录组的贝叶斯建模显示出共享的预测特征标志 Elio Nushi，Julia Manninen，Per Johansson，Antti Honkela，Johanna Björkroth bioRxiv 2026.06.11.731636； doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.11.731636
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.11.731636v1?rss=1
🏷️ 肉鸡肉腐败 宏转录组 贝叶斯建模 高斯过程 微生物群动态 保质期预测