AMaNITA：用于原生 tRNA 纳米孔测序数据分析的端到端工作流程

转运RNA（tRNA）分子在蛋白质翻译过程中充当关键的衔接适配体。尽管基于 Oxford Nanopore Technologies 的直接 RNA 测序（DRS）已成为开展系统性 tRNA 组分析的强大平台，但目前我们仍缺乏一种针对纳米孔 tRNA 数据分析的简洁且稳健的统计学框架。在此，我们通过开发 AMaNITA（Abundance, Modifications, and Nanopore Intensity Toolbox Application）来填补这一空白。AMaNITA 是一个端到端的生物信息学工作流程，可实现对纳米孔天然 tRNA 测序数据集的简化、稳健且可扩展的分析。 AMaNITA 对整个分析流程进行了整合与简化：从上游处理（碱基识别、比对、过滤、批次效应校正）到下游对 tRNA 差异丰度和修饰化学计量的评估。该工作流程可生成交互式 HTML 报告，用于数据探索与分析，并允许用户下载源数据文件及生成的图表。AMaNITA 可通过命令行使用 Singularity 运行，无需安装任何依赖项。

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