高分辨率转录组分析揭示了古菌病毒SSV1中多层次且动态的转录结构

感染嗜热嗜酸性Sulfolobales的梭形病毒科（Fuselloviridae）是研究最为深入的古菌病毒之一，其中，Saccharolobus spindle shaped virus 1（SSV1）与Saccharolobus solfataricus之间的相互作用被作为一个模式系统。感染后，SSV1建立慢性感染，新生病毒粒子持续从受感染细胞中出芽释放。紫外线照射可触发病毒复制、增加病毒粒子产量，并启动一个受到严密调控的时间性转录周期。然而，紫外诱导后基因调控的机制仍不清楚。 在本研究中，我们利用高分辨率长读长ONT-cappable-RNA测序，考察了SSV1在紫外诱导后的转录组图谱。通过对初级转录本进行端到端测序，我们构建了SSV1的全面转录图谱，鉴定出21个转录起始位点（TSS），其中12个为新描述位点；以及19个转录终止位点（TTS），其中9个为新发现位点。这使我们能够对整个基因组范围内的转录单元和操纵子结构进行精细修订。我们还发现了5个新的反义RNA，其中包括一个编码于推定病毒毒素基因a291开放阅读框反义链上的反义RNA，我们推测其为一种顺式编码调控RNA。此外，我们证实了SSV1结构基因vp1和vp3中两个直接重复序列之间发生的自发重组。据我们所知，这是cappable-seq技术首次应用于古菌病毒，也是首次对SSV1转录组进行单碱基分辨率分析。该研究揭示了此前未被充分认识的转录复杂性水平，展示了高分辨率转录组学如何加深对病毒转录组结构及其调控网络的理解。

本网站正在使用一项安全服务来保护自身免受在线攻击。您刚才执行的操作触发了该安全防护机制。可能触发此拦截的行为包括提交某些特定单词或短语、SQL 命令或格式错误的数据。

您可以向网站所有者发送电子邮件，告知其您已被拦截。请在邮件中说明此页面出现时您正在进行的操作，并附上本页面底部显示的 Cloudflare Ray ID。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.17.732947v1?rss=1

🏷️ 古菌病毒 转录组分析 长读长测序 转录起始位点 反义RNA