莎草科全着丝粒多样性:帚灯草亚科与莎草亚科中重复序列组织的对比

root 提交于 周四, 06/18/2026 - 02:47
着丝粒确保染色体的准确分离,并且在单着丝粒染色体中通常局限于一个单一的局部区域。相比之下,全着丝粒染色体的动粒活性沿染色体全长分布。尽管全着丝粒性在莎草科中广泛存在,但这些着丝粒的组成与组织方式,以及它们的进化分化,仍然知之甚少。本文通过结合基因组组装、重复组特征分析(RepeatExplorer)、荧光原位杂交(FISH)和免疫定位,研究了莎草科两个亚科代表物种——藨草亚科的 Hypolytrum schraderianum Nees 和莎草亚科的 Cladium mariscus (L.) Pohl——的着丝粒组织。纳入 Rhynchospora breviuscula(n = 5)和 Carex littledalei(n = 29)基因组的比较共线性分析鉴定出保守区块,最终几乎扩展覆盖了 H. schraderianum(n = 30)和 Cl. mariscus(n = 39)的整条染色体,尽管它们在染色体数目上存在差异,且在莎草科内部具有深远的进化距离。移动元件丰度极低且呈均匀分散分布,其中 Ty1/Copia Angela 在两个物种中均为最丰富的类型。在 Cl. mariscus 中,全着丝粒显示出着丝粒和动粒相关蛋白沿染色体的广泛分布,并且在很大程度上与形成分散簇的两类卫星 DNA 重复序列共定位。相比之下,H. schraderianum 也在线染色单体沿线显示出动粒信号,但其最丰富的卫星 DNA 家族富集于染色体末端和中间区域,而非沿染色单体交错分布。综上,这些结果揭示了在系统发育上不同的莎草科谱系中,支撑全着丝粒组织的不同基因组结构,并表明该科的全着丝粒已发生分化,在其与重复 DNA 关联的着丝粒组织方面存在变异。

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🏷️ 全着丝粒 莎草科 着丝粒组织 卫星DNA 重复序列 染色体进化