用于代谢组学和细胞内代谢物定量的 13C 酵母提取物内标实验室规模制备方案

root 提交于 周三, 06/17/2026 - 12:47
代谢组学能够对小分子代谢物进行谱分析,从而捕捉生物体在特定时刻的生化状态,并监测其细胞对刺激的响应。该技术已成为制药研究、食品工业和微生物研究中的强大工具。代谢组学旨在获得无偏的代谢谱;然而,这一目标因化合物不稳定、样品处理过程复杂且通常步骤繁多,以及质谱分析中的非线性响应而变得复杂。因此,校正代谢物损失和质谱相关伪影至关重要,而这通常是通过以每种目标代谢物对应的同位素标记内标进行相对定量来实现的。本文描述了如何制备13C标记酵母提取物,并将其用作代谢组学的内标。更具体地说,本文提供了补料分批发酵、淬灭、代谢物提取,以及该内标的LC-MS和GC-MS表征的逐步操作方案。本文还包括一项方案,说明如何使用该内标对酵母样品中的代谢物进行定量。

代谢组学能够对小分子代谢物进行谱分析,从而捕捉生物体在特定时刻的生化状态,并能够监测其细胞对刺激的响应。该技术已成为药物研究、食品工业和微生物研究中的有力工具。代谢组学旨在获得无偏的代谢谱;然而,这一目标会受到化合物不稳定性、复杂且往往繁琐的样品处理过程以及质谱分析中的非线性响应等因素的影响。因此,对代谢物损失和质谱相关伪影进行校正至关重要,通常通过针对每一种目标代谢物采用同位素标记内标进行相对定量来实现。本文介绍了如何制备13C标记的酵母提取物,并将其用作代谢组学的内标。更具体地说,本文提供了补料分批发酵、淬灭、代谢物提取以及内标的LC-MS和GC-MS表征的分步实验方案。文中还包括一套实验方案,说明如何使用该内标对酵母样品中的代谢物进行定量。


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.12.731807v1?rss=1

🏷️ 代谢组学 13C同位素标记 内标定量 酵母提取物 LC-MS/GC-MS