非人灵长类动物经精选的全基因组尺度核苷酸多样性面板

背景：灵长类是有胎盘类哺乳动物中系统发育和生态多样性最丰富的目之一，在推动我们对人类演化、物种形成过程和保护生物学的认识方面具有核心作用。尽管针对众多灵长类分类群已生成数千份全基因组序列，但数据处理中的差异——尤其是性连锁区域缺乏考虑倍性差异的变异检测——限制了现有数据集在大规模比较分析中的应用价值。 结果：在本研究中，我们利用公开可得的非人灵长类短读长测序数据、近期发表的灵长类基因组组装，以及一种考虑倍性差异的变异检测流程，构建了一个基因组尺度的核苷酸多样性面板，涵盖来自269个物种和71个属的3,240个个体。为进一步促进跨物种比较，我们还生成了用于变异检测的灵长类基因组组装的多基因组比对。 结论：这一经过整理的非人灵长类多样性资源为未来关于灵长类进化生物学、物种形成以及性染色体演化的研究奠定了基础（https://pure.au.dk/portal/en/datasets/primate-diversity-panel/）。

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🏷️ 非人灵长类 全基因组测序 核苷酸多样性 群体遗传 多基因组比对 性染色体演化