来自葡萄牙的两株高毒力稻瘟病菌田间分离株的高质量完整基因组

root 提交于 周三, 06/17/2026 - 12:47
真菌病原体稻瘟病菌(Pyricularia oryzae)因可在多种重要禾谷类作物上引发稻瘟病而臭名昭著,这些作物包括小麦、水稻、黍和燕麦。关于该病原体的全基因组数据对于更好地理解该真菌的宿主适应性至关重要,其中包括识别感染过程中的关键决定因子,从而实现更为精准的病害防控。在此,我们报告了两个采自葡萄牙稻田的分离株 M22.7 和 T22.2 的高连续性基因组序列(采用 PacBio 长读长测序技术获得),这两个分离株在水稻上表现出明显不同的侵染性症状。本研究对线粒体基因组序列和核基因组序列均进行了表征。所得核基因组组装长度分别为:M22.7 为 46.4 Mb(198× 覆盖度),T22.2 为 46.3 Mb(163× 覆盖度);其 BUSCO 完整性接近完全(98.8%),且污染评分为 0%(EukCC)。 表型分析表明,M22.7 的毒力高于 T22.2,这可能可由相较于 T22.2,M22.7 具有更少的预测效应子基因以及更高的转座元件含量来解释。该研究公告提供了 20 余年来首个来自葡萄牙天然稻瘟病菌分离株的基因组资源,填补了欧洲主要水稻生产国之一在该领域的重要数据空白;该国在特定农业生态环境条件下(靠近大西洋海岸)生产具有本地适应性的水稻品种。

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📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.12.731836v1?rss=1

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