MacaSurfer:贯穿整个生命周期的猕猴脑表面—体积统一映射

root 提交于 周三, 06/17/2026 - 22:47
猕猴脑 MRI 是转化神经科学与比较神经科学的核心工具,然而,多中心、纵向以及跨物种分析长期受到缺乏统一、自动化结构处理工具的制约。现有流程大多改编自人类神经影像学流程,或仅限于彼此割裂的处理步骤,无法在异质性采集条件和不同发育阶段下提供稳健的表面—体积表征。本文介绍 MacaSurfer,这是一个完全集成自动化并经过容器化封装的框架,用于实现猕猴全生命周期脑结构的统一表面—体积映射。MacaSurfer 包含针对猕猴解剖特征定制的组件:组织分割模型、仅基于 T1 加权图像优化结构映射的组织引导偏置场校正方法、拓扑感知的表面重建,以及表面感知的体积配准。在来自 39 个国际站点的 965 只猕猴共 1,346 次成像会话上(年龄范围覆盖出生后 2 周至 23 岁)进行验证后,MacaSurfer 展现出卓越的解剖一致性、测试—重测精度以及对图像退化的稳健性。基于 MacaSurfer 提取的形态测量指标,我们利用 835 只猕猴建立了规范化发育轨迹,为下游个体化偏离分析提供了标准化参照。MacaSurfer 已公开提供源代码、容器和预训练模型,构建了一个可复现的生态系统,以加速发育、转化和比较神经影像学研究。

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