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目的:母体体重指数(BMI)常被用作代谢状态的衡量指标,而母体BMI升高或降低均与跨代心脏代谢性疾病风险增加相关。胎盘介导这些母体代谢信号;然而,其为响应母体BMI而产生的全基因组转录适应仍未被充分界定。 方法:为界定胎盘中其转录本丰度随母体孕前BMI变化而改变的基因、通路及相互作用簇,开展了基于人类胎盘RNA测序数据集的全基因组Meta分析。将来自4个公开可用队列(n=146)的胎盘RNA测序读段比对至GRCh38参考基因组,并鉴定差异表达基因。另对一个独立的微阵列队列(n=19)进行单独再分析,以促进跨平台比较。功能富集分析采用了GO、KEGG和STRING蛋白相互作用资源。 结果:对146份RNA测序样本的Meta分析在低体重妊娠的胎盘中鉴定出8个具有全基因组显著性的基因,其中包括炎症信号基因MAP4K1和代谢酶PSPH,而超重和肥胖组仅显示名义显著的差异表达。KEGG分析表明,随着母体BMI增加,氧化磷酸化显著下调;蛋白—蛋白相互作用网络显示,在超重和肥胖组中,炎症介质为中心节点。独立微阵列验证证实了关键发现,包括肥胖中氧化磷酸化持续性下调这一一致结果。 结论:母体BMI与涉及炎症、代谢及激素通路的胎盘转录组特征相关,且氧化磷酸化在不同平台间均表现出一致性下调。这项全基因组Meta分析提供了一个可重复的、对BMI有响应的胎盘转录本目录,这些转录本可能促成子代健康的发育编程。
目的:母体体重指数(BMI)常被用作代谢状态的衡量指标,而母体BMI升高或降低均与跨代心脏代谢性疾病风险增加相关。胎盘介导这些母体代谢信号;然而,其针对母体BMI变化所产生的全基因组转录适应仍未得到充分界定。
方法:为界定胎盘中其转录本丰度随母体孕前BMI变化而改变的基因、通路及相互作用簇,本研究对人类胎盘RNA测序数据集进行了全基因组荟萃分析。来自4个公开可用队列(n=146)的胎盘RNA-seq读段被比对至GRCh38参考基因组,并鉴定差异表达基因。另对一个独立的微阵列队列(n=19)进行了单独再分析,以促进跨平台比较。功能富集分析采用了GO、KEGG和STRING蛋白相互作用资源。
结果:对146份RNA-seq样本的荟萃分析在低体重妊娠胎盘中鉴定出8个达到全基因组显著性的基因,其中包括炎症信号基因MAP4K1和代谢酶PSPH,而超重和肥胖类别则显示出名义显著性的差异表达。KEGG分析表明,随着母体BMI增加,氧化磷酸化显著下调;蛋白质—蛋白质相互作用网络显示,在超重和肥胖组中,炎症介质为中心节点。独立的微阵列验证证实了关键发现,包括肥胖中氧化磷酸化持续下调这一一致结果。
结论:母体BMI与胎盘转录组特征相关,这些特征涉及炎症、代谢和激素通路,且氧化磷酸化在不同平台间均表现出一致性下调。该全基因组荟萃分析提供了一份具有可重复性的BMI响应性胎盘转录本目录,可能有助于解释子代健康发育编程。
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.10.731498v1?rss=1
🏷️ 母体BMI 胎盘转录组 母胎界面 氧化磷酸化 炎症信号 荟萃分析
来源出处
母体BMI与胎盘转录组变化:母胎界面基因表达的荟萃分析
https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.10.731498v1?rss=1