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气候变化和富营养化正在推动包括副溶血性弧菌（V. parahaemolyticus）在内的弧菌属物种分布范围的扩张。该细菌是一种重要的食源性病原体，理解该物种毒力菌株的生物地理分布对于保障食品安全至关重要。全基因组测序（WGS）可提供细菌菌株水平的鉴定，并被广泛用于细菌病原体的追踪；然而，WGS成本高且劳动密集。基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）为细菌鉴定提供了一种快速、准确且经济有效的方法；然而，针对副溶血性弧菌，MALDI-TOF MS与WGS的分辨能力尚未得到系统比较。 在本研究中，从采自墨西哥湾沿岸和马萨诸塞州的牡蛎（Crassostrea virginica）中分离获得了70株副溶血性弧菌。牡蛎采集自得克萨斯州加尔维斯顿湾和马萨诸塞州的水产养殖区，并购自美国得克萨斯州和路易斯安那州的海鲜市场。作为比较，从购自得克萨斯州锡布鲁克一家海鲜市场的蓝蟹外骨骼中培养获得了2株鳗弧菌（V. anguillarum）分离株。所有分离株均使用MALDI Biotyper系统进行鉴定，并利用定制R脚本进行分析。基于MALDI-TOF MS生成的质谱进行的聚类分析以及系统基因组学分析均揭示出与牡蛎来源相对应的不同聚类。在质谱分析和WGS分析中，从马萨诸塞州分离的副溶血性弧菌菌株均形成了一个一致的聚类。对于种间比较，MALDI-TOF MS生成的质谱余弦相似度范围为0.43至0.59，而WGS生成的平均核苷酸一致性（ANI）值范围为76%至77%。对于种内比较，质谱余弦相似度范围为0.68至0.91，ANI值范围为98%至100%。这些结果表明，MALDI-TOF MS具有与WGS相当的分辨率，可用于追踪与牡蛎相关的副溶血性弧菌菌株。
气候变化和富营养化正在推动包括副溶血性弧菌（V. parahaemolyticus）在内的弧菌属物种分布范围的扩张。该细菌是一种重要的食源性病原体，理解该物种毒力菌株的生物地理分布对于保障食品安全至关重要。全基因组测序（WGS）可在菌株水平上对细菌进行鉴定，并被广泛用于细菌病原体的追踪；然而，WGS成本高且劳动密集。基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）为细菌鉴定提供了一种快速、准确且具有成本效益的方法；然而，针对副溶血性弧菌，MALDI-TOF MS与WGS的分辨能力尚未进行系统比较。
在本研究中，从采集于墨西哥湾沿岸和马萨诸塞州的牡蛎（Crassostrea virginica）中分离获得了70株副溶血性弧菌。牡蛎采自得克萨斯州加尔维斯顿湾和马萨诸塞州的水产养殖区，并购自美国得克萨斯州和路易斯安那州的海鲜市场。作为比较，从购自得克萨斯州锡布鲁克一家海鲜市场的蓝蟹外骨骼中培养分离了2株鳗弧菌（V. anguillarum）。所有分离株均采用MALDI Biotyper系统进行鉴定，并使用定制的R脚本进行分析。MALDI-TOF MS生成的质谱聚类分析及系统基因组学分析均揭示出与牡蛎来源相对应的不同聚类。在质谱分析和WGS分析中，来自马萨诸塞州分离的副溶血性弧菌菌株均形成了一个一致的聚类。种间比较中，MALDI-TOF MS生成的质谱余弦相似度范围为0.43至0.59，WGS生成的平均核苷酸一致性（ANI）值范围为76%至77%。种内比较中，质谱余弦相似度范围为0.68至0.91，ANI值范围为98%至100%。这表明，MALDI-TOF MS具有与WGS相当的分辨率，可用于追踪与牡蛎相关的副溶血性弧菌菌株。
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.11.731630v1?rss=1
🏷️ 副溶血性弧菌 MALDI-TOF质谱 全基因组测序 菌株分型 牡蛎食品安全