不同类型的肠道菌群失调及口腔-肠道微生物特征可区分艰难梭菌、弯曲杆菌和沙门氏菌感染：一项横断面研究

胃肠道细菌感染与肠道微生物群的显著扰动相关，然而大多数微生物组研究均孤立地考察单一病原体，从而限制了对肠道感染中共有及病原体特异性微生物特征的识别。我们采用16S rRNA基因测序，对586份粪便样本的粪便微生物群谱进行了比较分析，涵盖由艰难梭菌、弯曲杆菌属和沙门菌属引起的感染，以及病毒性胃肠炎、诊断阴性样本和健康对照。我们还在部分样本中测定了粪便钙卫蛋白浓度，以评估肠道炎症。 比较分析显示，细菌性肠道感染中存在两种主要的菌群失调构型。艰难梭菌感染的特征为以肠球菌属占优势的群落结构，而弯曲杆菌属和沙门菌属感染则与一组高度相关的口腔相关菌群富集有关，其中包括链球菌属、颗粒链球菌属和嗜血杆菌属。这些菌属是XGBoost机器学习分类器中信息量最高的特征之一，该分类器能够准确地区分不同类型的细菌感染，并将其与病毒感染及健康相关微生物群谱区分开来（宏平均F1分数 = 0.74）。相比之下，肠杆菌科的扩张代表了一种共有的、非特异性的肠道扰动特征，并与升高的粪便钙卫蛋白浓度相关。 综上，这些发现表明，细菌性肠道感染与不同的微生物群构型相关，这些构型能够将病原体特异性特征与一般感染相关的菌群失调区分开来。弯曲杆菌属和沙门菌属感染中口腔相关菌群的富集提示口腔—肠道微生物轴在细菌性胃肠炎中可能发挥作用，并为未来的机制研究以及基于微生物群信息的诊断、预防和治疗策略的开发奠定了基础。

胃肠道细菌感染与肠道微生物群的显著扰动相关，然而，大多数微生物组研究均孤立地考察单一病原体，从而限制了对肠道感染中共有及病原体特异性微生物特征的识别。我们采用16S rRNA基因测序，对586份粪便样本的粪便微生物群谱进行了比较分析，涵盖由艰难梭菌、弯曲杆菌属和沙门菌属引起的感染，以及病毒性胃肠炎、诊断阴性样本和健康对照。我们还在部分样本中测定了粪便钙卫蛋白浓度，以评估肠道炎症。

比较分析揭示了细菌性肠道感染中的两种主要菌群失调构型。艰难梭菌感染的特征是以肠球菌占优势的群落结构，而弯曲杆菌属和沙门菌属感染则与一个紧密相关的口腔相关菌群联合体富集有关，其中包括链球菌属、颗粒链球菌属和嗜血杆菌属。这些菌群是XGBoost机器学习分类器中信息量最大的特征之一，该分类器能够准确地区分不同类型的细菌感染，并将其与病毒感染及健康相关的微生物群谱区分开来（宏平均F1评分 = 0.74）。相比之下，肠杆菌科的扩增代表了一种共有的、非特异性的肠道扰动特征，并与升高的粪便钙卫蛋白浓度相关。

综上，这些发现表明，细菌性肠道感染与不同的微生物群构型相关，这些构型能够将病原体特异性特征与一般感染相关的菌群失调区分开来。弯曲杆菌属和沙门菌属感染中口腔相关菌群的富集提示，口腔—肠道微生物轴可能在细菌性胃肠炎中发挥潜在作用，并为未来机制研究以及开发基于微生物群信息的诊断、预防和治疗策略奠定了基础。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.15.732290v1?rss=1

🏷️ 肠道菌群失调 艰难梭菌感染 弯曲杆菌感染 沙门氏菌感染 口腔-肠道微生物轴 16S rRNA测序