牛痘病毒CPXV012的膜依赖性结构组织及其对TAP的识别

牛痘病毒CPXV012通过干扰TAP依赖性的肽转运抑制MHC I类抗原呈递，但其膜依赖性结构组织及动态行为仍未得到充分界定。在本研究中，我们考察了CPXV012在膜模拟环境中以及在CPXV012-TAP复合物模型中的构象性质。CPXV012被划分为三个肽构建体，分别对应N端胞质区、跨膜区和C端内质网腔域。采用圆二色谱、二维及多维NMR波谱以及分子动力学模拟对这些肽进行分析，并将所得结构信息整合为全长CPXV012模型。 CD谱显示，CPX-E1和CPX-C2在水溶液中主要呈无序状态，但在DPC胶束中获得有序、主要为α螺旋的结构特征。在DPC-d38胶束中的NMR分析提供了残基水平的归属及结构约束，支持对这两种肽进行受限结构计算。在针对CPXV012-TAP复合物开展的三次独立1 μs分子动力学模拟中，CPXV012保持了可重复的双螺旋组织。N端/跨膜区域表现为相对稳定的结构元件，而内质网腔段则表现出更高的局部柔性。界面分析表明，CPXV012同时与TAP1和TAP2接触，重复出现的相互作用集中于腔面Y47-I69区域，并涉及极性及电荷互补性接触。 这些结果支持这样一种模型：膜相关的结构化使CPXV012处于有利于TAP识别的构象状态，而柔性的内质网腔区域构成其与TAP相互作用的主要表面。该结构框架补充了现有关于CPXV012介导TAP抑制的功能模型。

牛痘病毒CPXV012通过干扰TAP依赖性肽转运来抑制MHC I类抗原呈递，但其膜依赖性结构组织及动态行为尚未得到充分界定。在本研究中，我们考察了CPXV012在膜模拟环境中以及在CPXV012-TAP复合物模型中的构象特性。将CPXV012划分为三个肽构建体，分别对应N端胞质区、跨膜区和C端内质网腔域。采用圆二色谱、 多维NMR谱以及分子动力学模拟对这些肽进行了分析，并将所得结构信息整合为一个全长CPXV012模型。

CD光谱表明，CPX-E1和CPX-C2在水溶液中主要呈无序状态，但在DPC胶束中获得了有序、且主要为α-螺旋的结构特征。在DPC-d38胶束中的NMR分析提供了残基水平的归属和结构约束，支持对这两种肽进行受限结构计算。在针对CPXV012-TAP复合物开展的三次相互独立的1微秒分子动力学模拟中，CPXV012保持了可重复的双螺旋组织。N端/跨膜区域表现为相对稳定的结构单元，而内质网腔段则显示出更高的局部柔性。界面分析表明，CPXV012同时与TAP1和TAP2发生接触，其中反复出现的相互作用集中于腔内Y47-I69区域，并涉及极性及电荷互补性接触。

这些结果支持这样一种模型：膜相关结构化使CPXV012处于有利于TAP识别的构象状态，而柔性的内质网腔区域则构成与TAP相互作用的主要表面。这一结构框架补充了现有关于CPXV012介导TAP抑制的功能模型。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.12.731803v1?rss=1

🏷️ 牛痘病毒CPXV012 TAP转运体 MHC I类抗原呈递 膜蛋白结构 NMR波谱 分子动力学模拟