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实验室模型是研究寄生虫生物学和致病机制的宝贵工具，尤其对于蠕虫感染而言更是如此。然而，蠕虫复杂的生活史以及通常较窄的宿主特异性，使得在实验室条件下持续获得关键寄生虫材料面临挑战。对于美洲板口线虫（Necator americanus）而言，这一点尤为突出；它是全球范围内感染人类最常见的钩虫种类。在此，我们报告了一个来源于非洲的美洲板口线虫菌株在实验室中的成功适应过程，该菌株最初分离自加纳Beposo地区受感染个体。Beposo株已在口服地塞米松处理的金黄叙利亚仓鼠中成功连续传代9代。我们采用虫卵孵化试验评估了其对甲苯咪唑和阿苯达唑的差异敏感性，并对β-微管蛋白1型同种型基因进行了DNA测序，结果未在该地方性菌株中发现已知的耐药相关突变。线粒体COX1基因测序显示，来自加纳的美洲板口线虫样本以及已报道的多哥序列，与来自南美和亚洲的样本存在差异。基于微卫星标记的补充性群体分析进一步揭示了初始寄生虫种群中存在显著的遗传变异。为进一步表征这一新的Beposo株，我们利用针对低起始量样本优化的Oxford Nanopore Technologies MinION文库制备方法，从单条成年雄虫提取的基因组DNA构建了一个基因组杂合草图组装。该高质量组装包含完整的线粒体基因组，总长度为202.8 Mb，由950条contig组成，N50大于449 kb。该组装包含超过95%的保守线虫直系同源基因，且均以完整单拷贝形式存在；基于同源性的基因预测估计其包含12,804个基因。本研究首次对一个源自非洲、并已成功适应实验动物模型的美洲板口线虫菌株进行了全面表征。
实验室模型是研究寄生虫生物学和致病机制，尤其是蠕虫感染的重要工具。然而，蠕虫复杂的生活史以及通常较窄的宿主特异性，使得在实验室环境中持续获得关键寄生虫材料面临挑战。对于美洲板口线虫（Necator americanus）而言，这一点尤为突出；它是全球感染人类最常见的钩虫种类。在此，我们报道了一株非洲来源的美洲板口线虫实验室适应株的成功建立，该虫株最初分离自加纳贝波索（Beposo）的感染者。Beposo虫株已在口服地塞米松维持的金黄叙利亚仓鼠中成功传代9代。我们采用虫卵孵化实验评估了其对甲苯咪唑和阿苯达唑的差异敏感性，并对β-微管蛋白同型1基因进行了DNA测序，结果未在该地方性虫株中发现已知的耐药相关突变。线粒体COX1基因测序显示，来自加纳的美洲板口线虫样本以及已报道的多哥序列，与南美和亚洲来源的样本存在差异。基于微卫星标记的补充群体分析进一步揭示了初始寄生虫群体中存在显著的遗传变异。为进一步表征这一新的Beposo虫株，我们利用针对低输入样本类型优化的Oxford Nanopore Technologies MinION文库制备方法，从单条成年雄虫提取的基因组DNA构建了基因组杂合草图组装。该高质量组装包含完整的线粒体基因组，总大小为202.8 Mb，由950条contig组成，N50大于449 kb。其中，超过95%的保守线虫直系同源基因以完整单拷贝形式存在；基于同源性的基因预测估计其包含12,804个基因。本研究首次对一株起源于非洲、并已成功适应实验动物模型的美洲板口线虫虫株进行了全面表征。
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.10.728644v1?rss=1
🏷️ 美洲板口线虫 实验室适应 全基因组组装 群体遗传变异 抗蠕虫药敏感性