从海洋海绵和珊瑚中分离的假单胞菌门微小球菌属三个新种的系统基因组学描述

研究不足的细菌属呈现出动态的系统发育图景，并且随着更多菌株被分离以及基因组数据的增加，为发现新分类单元提供了机会。在此，我们通过系统基因组学分析，描述了全球广泛分布的海洋细菌属 Microbulbifer 的三个新物种。该属广泛存在于海水微生物组中，并已被证实是生物降解酶以及高价值小分子天然产物的可靠来源。与已知最近缘物种 Microbulbifer variabilis ATCC 700307T 相比，这三个新物种的平均核苷酸一致性（ANI）均低于 88.4%。 对这三个新物种的分离株——分别命名为 PAAF003T（T = 模式菌株）、ZKSA006T 和 SSSA003T——进行了成像观察，以揭示其形态学特征。基于系统发育数据，菌株 PAAF003T、ZKSA006T 和 SSSA003T 代表了 Microbulbifer 属的三个新物种，依据 SeqCode，现分别提议命名为 Microbulbifer maximicatervae sp. nov.、Microbulbifer regidiadema sp. nov. 和 Microbulbifer mixtoriginis sp. nov.。我们还重建了现有 Microbulbifer 基因组的稳健系统发育关系，这将有助于未来的菌株分离与描述研究。

研究不足的细菌属呈现出动态的系统发育格局，并且随着更多菌株被分离以及基因组数据的不断补充，为发现新分类单元提供了机会。在此，我们通过系统基因组学分析，描述了全球广泛分布的海洋细菌属 Microbulbifer 中的三个新物种。该属广泛存在于盐水微生物组中，并且已被证实是生物降解酶以及高价值小分子天然产物的可靠来源。与已知最接近物种 Microbulbifer variabilis ATCC 700307T 相比，这三个新物种的平均核苷酸一致性（ANI）均低于 88.4%。三个新物种的分离株分别命名为 PAAF003T（T = 模式菌株）、ZKSA006T 和 SSSA003T，并通过成像揭示了其形态学特征。基于系统发育数据，菌株 PAAF003T、ZKSA006T 和 SSSA003T 代表了 Microbulbifer 属的三个新物种，依据 SeqCode，分别提出命名为 Microbulbifer maximicatervae sp. nov.、Microbulbifer regidiadema sp. nov. 和 Microbulbifer mixtoriginis sp. nov.。我们还重建了现有 Microbulbifer 基因组的稳健系统发育关系，这将有助于未来的分离培养和菌株描述研究。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.10.731415v1?rss=1

🏷️ 系统基因组学 新种鉴定 海洋细菌 微小球菌属 系统发育 平均核苷酸一致性