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宿主相关微生物组在生物体健康、生态相互作用和进化中发挥着至关重要的作用，然而，对于微生物群落在从水生环境向日益陆生化栖息地过渡过程中如何发生变化，人们所知甚少。在本研究中，我们表征了关岛潮间带梯度上占据不同生态位的三种梳齿鳚皮肤微生物组：Blenniella paula、Praealticus labrovittatus 和 Alticus arnoldorum，其栖息环境从完全潮下带（且完全水生）到潮间带（两栖）再到潮上带环境（完全陆生）不等。利用16S rRNA扩增子测序，我们将皮肤相关细菌群落与周围海水及基质生物膜中的细菌群落进行了比较，以评估栖息地对微生物组结构的影响。皮肤微生物组与环境微生物群落存在明显差异，表明宿主对微生物组具有强烈的生态过滤作用。三种物种中皮肤微生物组与基质微生物组之间的分化程度，与它们沿潮间带梯度逐渐向更高带位分布的格局相一致。其中，差异最大的是潮上带鱼类 A. arnoldorum 的皮肤微生物组，其特征表现为 γ-变形菌纲丰度较高，以及附生性和黏液相关类群的富集。在所有物种中，我们鉴定出32个相对于环境样本在皮肤上显著富集的微生物目，其中包括通常与鱼类黏膜相关的类群（如 Vibrio、Alteromonas、Cetobacterium），以及一些在水生海洋鱼类中鲜有报道的类群（如 Rubritalea、Granulosicoccus）。此外，还检测到若干具有潜在致病性的稀有类群，但其丰度较低。综上所述，这些发现表明，从潮下带（水生）到潮上带（陆生）的栖息地中，栖息地特异性的选择压力强烈塑造了鱼类皮肤微生物组，并提示微生物共生体可能有助于支撑两栖生活方式所需的生态与生理适应。本研究首次对沿潮间带梯度分布的两栖鱼类物种之间皮肤微生物组的分化进行了比较评估，并为预测微生物组对环境变化的响应提供了一个框架。
宿主相关微生物组在个体健康、生态相互作用和进化中发挥着至关重要的作用，然而，对于微生物群落在从水生环境向日益陆生化栖息地过渡过程中如何发生变化，人们仍知之甚少。在本研究中，我们表征了关岛潮间带梯度上占据不同生态位的三种梳齿鳚鱼类（Blenniella paula、Praealticus labrovittatus 和 Alticus arnoldorum）的皮肤微生物组，这一梯度涵盖了从完全潮下带（且完全水生）到潮间带（两栖）以及潮上带环境（完全陆生）。利用16S rRNA扩增子测序，我们将皮肤相关细菌群落与周围海水和基质生物膜中的细菌群落进行了比较，以评估栖息地对微生物组结构的影响。皮肤微生物组与环境微生物群落明显不同，表明宿主具有强烈的生态过滤作用。三种鱼类中，皮肤微生物组与基质微生物组之间的分化与其沿潮间带梯度逐渐向更高区域分布的格局相一致。差异最显著的皮肤微生物组来自潮上带鱼类 A. arnoldorum，其特征是γ-变形菌纲丰度较高，并富集了附生性类群和黏液相关类群。
在所有物种中，我们鉴定出32个与环境样本相比在皮肤上显著富集的微生物目，其中包括通常与鱼类黏膜相关的类群（如 Vibrio、Alteromonas、Cetobacterium），以及一些在水生海洋鱼类中鲜有报道的类群（如 Rubritalea、Granulosicoccus）。此外，还在低丰度水平检测到若干具有潜在致病性的稀有类群。综上所述，这些发现表明，栖息地特异性的选择压力强烈塑造了鱼类皮肤微生物组，使其沿着从潮下带（水生）到潮上带（陆生）的栖息地梯度发生变化，并提示微生物共生体可能有助于支持两栖生活方式所需的生态和生理适应。本研究首次对潮间带梯度上两栖鱼类物种之间皮肤微生物组分化进行了比较评估，并为预测微生物组对环境变化的响应提供了一个框架。
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.09.731066v1?rss=1
🏷️ 皮肤微生物组 潮间带梯度 两栖鱼类 16S rRNA测序 宿主生态过滤 栖息地分化