番泻苷A和头孢他啶抑制SARS-CoV-2、SARS-CoV和MERS-CoV中核衣壳蛋白与RNA的结合

SARS-CoV、MERS-CoV 和 SARS-CoV-2 典型地表明了冠状病毒所构成的持续威胁：其具备动物源性跨种传播、快速传播和高致死率的能力，因此凸显了开发广谱抗病毒策略的迫切需求。核衣壳（N）蛋白对于 RNA 结合、基因组包装和病毒复制至关重要，在冠状病毒之间高度保守，但迄今仍是一个尚未得到充分探索的抗病毒靶点。在我们先前的研究中，我们鉴定出两种可与 SARS-CoV-2 N 蛋白 N 端结构域结合并抑制其核酸结合的小分子——头孢他啶和番泻苷 A，并利用 NMR 化学位移扰动实验确定了它们的结合位点。在本研究中，我们观察到若干参与抑制剂结合的残基在乙型冠状病毒中是保守的，这提示存在一种共同的、可成药的脆弱位点。我们纯化了来源于 SARS-CoV、MERS-CoV 和 SARS-CoV-2 的重组 N 蛋白，并通过电泳迁移率变动分析证明，这两种化合物均可显著降低 RNA 结合。它们的半数抑制浓度（IC50）则通过荧光偏振法测定。分子对接分析表明，这两种抑制剂均靶向 N-NTD 的 RNA 结合口袋，这与一种保守的作用机制相一致。总体而言，我们的研究结果揭示了冠状病毒 N 蛋白中一个保守的 RNA 结合脆弱位点，并突出了这些抑制剂作为泛冠状病毒治疗药物的潜力。

SARS-CoV、MERS-CoV 和 SARS-CoV-2 充分表明了冠状病毒所构成的持续性威胁：其具备动物源性溢出的能力、快速传播性和高致死率，因此凸显了开发广谱抗病毒策略的迫切需求。核衣壳（N）蛋白对于 RNA 结合、基因组包装和病毒复制至关重要，在冠状病毒中具有高度保守性，但仍是一个尚未得到充分探索的抗病毒靶点。在我们先前的研究中，我们鉴定出两种可与 SARS-CoV-2 N 蛋白 N 端结构域结合并抑制其核酸结合的小分子——头孢他啶和番泻苷 A，并利用 NMR 化学位移扰动实验鉴定了它们的结合位点。在本研究中，我们观察到若干参与抑制剂结合的残基在 β 冠状病毒中是保守的，这提示其可能存在共同的、可药物靶向的脆弱位点。我们纯化了来源于 SARS-CoV、MERS-CoV 和 SARS-CoV-2 的重组 N 蛋白，并通过凝胶迁移率变动分析证明，这两种化合物均可显著降低 RNA 结合能力。其半数抑制浓度（IC50）通过荧光偏振法测定。分子对接分析表明，这两种抑制剂均靶向 N-NTD 的 RNA 结合口袋，这与其保守的作用机制相一致。总体而言，我们的研究结果揭示了冠状病毒 N 蛋白中一个保守的 RNA 结合脆弱位点，并突出了这些抑制剂在泛冠状病毒治疗中的潜力。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.09.731089v1?rss=1

🏷️ 冠状病毒 核衣壳蛋白 RNA结合抑制 广谱抗病毒 药物再利用