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鼻窦鼻腔癌(SNC)是一种罕见且侵袭性强的头颈部肿瘤,可用治疗选择有限,其免疫微环境也尚未得到完整界定。尽管组织病理学仍然是临床肿瘤评估的核心,但免疫谱分析通常需要对组织进行解离,因此会丢失塑造抗肿瘤免疫反应的空间关系。在本研究中,我们结合单细胞RNA测序方法、空间转录组学以及我们近期首创的技术 Spatial V(D)J,对SNC的细胞组成、空间结构和克隆架构进行了分析。我们发现,SNC肿瘤具有显著的T细胞浸润,包括相当比例的经典组织驻留记忆(TRM)CD8+ T细胞和耗竭(TExh)CD8+ T细胞。 这种炎性表型伴随着大量具有抑制作用的调节性T(Treg)细胞浸润,这些细胞向 Tbet+CXCR3+ 表型分化。在空间分布上,扩增的Treg、CD8 T细胞和B细胞克隆集中于特化的瘤周免疫生态位内,这些生态位富集了癌相关成纤维细胞、CXCL9肿瘤相关巨噬细胞以及LAMP3IDO1树突状细胞。占据这些生态位的T细胞克隆与浸润于上皮性肿瘤区域的T细胞克隆具有克隆相关性,从而将淋巴样枢纽与更广泛的肿瘤免疫反应联系起来。总体而言,这些数据表明,SNC是一种具有炎性特征但同时高度免疫调节性的肿瘤类型,并揭示了一种空间有序的克隆架构,在该架构中,抑制性与细胞毒性淋巴细胞状态在CXCL9髓系生态位内并存。
免疫受体库谱分析揭示鼻窦癌中富含 CXCL9 的生态位内 T 细胞和 B 细胞的广泛克隆扩增 | bioRxiv
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免疫受体库谱分析揭示鼻窦癌中富含 CXCL9 的生态位内 T 细胞和 B 细胞的广泛克隆扩增
Javiera Alvarez,Eva Gracia Villacampa,Daniel Labuz,Mariia Guryleva,Egon Urgard,Asa Kagedal,Oscar Solmell,Anders Nasman,Javier Escudero Morlanes,Junjie Ma,Niels Odum,Adnane Achour,Susanna Georen,Benedict Chambers,Ben Murrell,Lars Olaf Cardell,Camilla Engblom,Kim Thrane,Jonathan M Coquet
doi: https://doi.org/10.64898/2026.06.04.730068
通讯作者: jonathan.coquet{at}ki.se
摘要
鼻窦癌(SNC)是一种罕见且侵袭性强的头颈部癌症,治疗选择有限,其免疫微环境尚未得到完整界定。尽管组织病理学仍是临床肿瘤评估的核心,但免疫分析通常需要对组织进行解离,因此会丢失塑造抗肿瘤免疫的空间关系。在持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 保留所有权利。未经许可不得转载或再利用。
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发表于 2026 年 6 月 8 日。
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Javiera Alvarez,Eva Gracia Villacampa,Daniel Labuz,Mariia Guryleva,Egon Urgard,Asa Kagedal,Oscar Solmell,Anders Nasman,Javier Escudero Morlanes,Junjie Ma,Niels Odum,Adnane Achour,Susanna Georen,Benedict Chambers,Ben Murrell,Lars Olaf Cardell,Camilla Engblom,Kim Thrane,Jonathan M Coquet
bioRxiv 2026.06.04.730068; doi: https://doi.org/10.64898/2026.06.04.730068
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免疫受体库谱分析揭示鼻窦癌中富含 CXCL9 的生态位内 T 细胞和 B 细胞的广泛克隆扩增
Javiera Alvarez,Eva Gracia Villacampa,Daniel Labuz,Mariia Guryleva,Egon Urgard,Asa Kagedal,Oscar Solmell,Anders Nasman,Javier Escudero Morlanes,Junjie Ma,Niels Odum,Adnane Achour,Susanna Georen,Benedict Chambers,Ben Murrell,Lars Olaf Cardell,Camilla Engblom,Kim Thrane,Jonathan M Coquet
bioRxiv 2026.06.04.730068; doi: https://doi.org/10.64898/2026.06.04.730068
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.04.730068v1?rss=1
🏷️ 免疫受体库 空间转录组学 T细胞克隆扩增 B细胞克隆扩增 肿瘤免疫微环境 CXCL9