泰国及东南亚大陆不同祖源多样性背景下的细胞复杂性与系统性免疫特征谱

尽管全球免疫基因组学参考数据不断丰富，东南亚大陆地区（MSEA）因其广泛的遗传异质性而仍然代表性不足。我们构建了首个东南亚大陆人群的单细胞免疫图谱，并采用亚洲免疫多样性图谱（AIDA）中的泰国个体作为代表性队列。我们证明，泰国人群具有高度的遗传多样性，这反映了其作为亚洲遗传混合地理枢纽的历史。通过整合单细胞转录组学与高分辨率基因分型数据，我们表明遗传祖源显著塑造了先天免疫特征，尤其是CD14+单核细胞的免疫谱系，并突出了针对区域性病原体的潜在进化适应。我们鉴定出特定的性别与祖源交互作用，这些作用可能驱动女性促炎通路的基线激活状态，从而为东南亚人群中自身免疫性疾病高患病率这一长期存在的现象提供了亟需的细胞学解释。最终，我们的研究揭示了群体特异性的遗传结构决定了免疫异质性，而这种异质性往往无法通过自我报告的族裔或原籍国加以准确识别，从而为东南亚大陆地区的精准医学提供了关键的免疫基因组学参考。

尽管东南亚大陆地区（MSEA）具有广泛的遗传异质性，但在全球免疫基因组学参考资源中仍然代表性不足。我们构建了首个东南亚大陆地区人群的单细胞免疫图谱，采用亚洲免疫多样性图谱（AIDA）中的泰国个体作为代表性队列。

我们证明，泰国人群具有高度的遗传多样性，这反映了其作为亚洲基因混合地理枢纽的历史。通过整合单细胞转录组学与高分辨率基因分型数据，我们表明遗传祖源显著塑造了先天免疫特征，尤其是在CD14+单核细胞中，从而凸显了针对区域性病原体的潜在进化适应。

我们识别出特定的性别—祖源相互作用，这些相互作用可能驱动女性促炎通路的基础激活状态，为长期以来观察到的东南亚人群中自身免疫性疾病高患病率提供了细胞层面的解释依据。最终，我们的研究揭示，人群特异性的遗传结构决定了免疫异质性，而这种异质性常常无法通过自我报告的族群身份或原籍国家加以捕捉，从而为东南亚大陆地区的精准医学提供了关键的免疫基因组学参考。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.08.726441v1?rss=1

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