纳米孔直接RNA测序实现了人类核糖体RNA中假尿苷位点分辨定量的可重复检测

假尿苷是人类核糖体RNA中最丰富的转录后修饰，已注释位点超过110个，并且其化学计量在不同生物学背景下存在变异。现有定量方法要么通量较低，要么受限于预定义的检测面板。 我们以人类肝组织、诱导多能干细胞和HeLa细胞中经质谱验证的位点为基准，对采用Dorado v5.1模型的纳米孔直接RNA测序进行了评估。纳米孔测序检测到了117个已验证位点中的95个，并在其中85%的位点上实现了对化学计量的准确量化，且具有较高的可重复性。低GC含量环境是导致检测失败的主要原因。这些结果确立了纳米孔测序作为可扩展的表观转录组假尿苷谱分析工具的地位。

假尿苷是人类核糖体RNA中最丰富的转录后修饰，已有超过110个位点被注释，并且其化学计量在不同生物学背景下呈现可变性。现有定量方法通量较低，或受限于预先定义的检测位点面板。

我们以人肝组织、诱导多能干细胞和HeLa细胞中经质谱验证的位点为基准，评估了采用Dorado v5.1模型的纳米孔直接RNA测序。纳米孔测序检测到了117个经验证位点中的95个，并以高重复性准确量化了其中85%位点的化学计量。低GC含量环境是导致检测失败的主要来源。

这些结果确立了纳米孔测序作为一种可扩展工具，可用于表观转录组学中假尿苷的图谱绘制。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.08.730855v1?rss=1

🏷️ 纳米孔直接RNA测序 假尿苷 核糖体RNA RNA修饰定量 表观转录组