全基因组序列的计算机模拟限制性位点分析揭示了由选择作用和序列重复引起的模式

众所周知，生物序列并非随机。因此，对随机序列与生物序列的计算机模拟限制性片段分布进行比较，可以作为这种非随机性的一个指标。我们的分析表明，对于大多数已测试的限制性内切酶与基因组序列组合，生物序列中每兆碱基的片段数相较于相应随机序列至少偏离10%以上。这种偏离呈现双向性，即明显升高的数值与明显降低的数值同样常见。尽管不存在物种特异性或限制性内切酶特异性的效应，但可以清楚地观察到限制性位点和基因组序列的GC含量所产生的显著影响。与随机序列不同，基因组序列在其片段长度分布中表现出明显的峰值，这提示存在诸如转座子之类的重复元件。

Lucia Vedder 报告称，Ark Biodiversity GmbH（地址：Willdenowstr. 6, 12203 Berlin, Germany）提供了资金支持。 Heiko Schoof 声明不存在任何已知的竞争性经济利益或可能被认为影响本文所报告工作的个人关系。

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🏷️ 全基因组序列 限制性位点分析 计算机模拟 GC含量 序列重复