采用 Illumina 平铺扩增方法进行麻疹病毒全基因组测序

麻疹病毒仍然是一个重大的全球健康威胁，尽管已有有效疫苗可用，但近年来全球麻疹病例仍持续增加。基因组监测已成为监测病毒传播和调查暴发情况的重要工具。在此，我们描述了一种采用平铺扩增子策略和 Illumina 测序技术进行麻疹病毒全基因组测序的湿实验方法。此前发表的一种基于 Oxford Nanopore 的平铺引物方案经过调整，以纳入当前传播的麻疹基因型，并适用于 Illumina 平台。研究对两种 Illumina 文库制备试剂盒——Illumina DNA Prep（IDP）和 Nextera XT（XT）——的性能进行了评估。与 XT 相比，IDP 试剂盒表现出更完整的基因组和更一致的基因组覆盖度。利用定量参考基因组，确定 B3 和 D8 基因型的检测限为 10,000 个基因组拷贝。序列准确性通过先前已表征的临床样本进行了评估，结果显示出高度一致性。该方法为在 Illumina 平台上进行麻疹病毒全基因组测序提供了一种可靠且灵敏的途径，适用于基因组监测应用。

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📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.13.724913v1?rss=1

🏷️ 麻疹病毒 全基因组测序 Illumina测序 平铺扩增子 基因组监测