新型烯醇化酶阴性 Segatella copri 亚种的鉴定支持了 Segatella copri 通过替代性磷酸烯醇式丙酮酸合成途径发生物种形成的观点

root 提交于 周六, 06/06/2026 - 14:47
Segatella copri 被认为是人类肠道中一种重要的、利用植物性纤维并以糖酵解为特征的细菌。本人近期的研究对植物性多糖对 S. copri 的积极影响提出了一种新的解释,即鉴定出 S. copri 与 Blautia 属菌种之间存在显著的负相关关系。Blautia 属菌种对电子供体的高消耗速率表明,对甲酸、铁氧还蛋白和延胡索酸等电子供体的竞争可能是这种负相关关系的途径,但这也能够解释其与植物性多糖的正相关关系,因为这些物质是在肠道内纤维发酵的产物。 通过 Prokka 对 42 个 S. copri 基因组进行了注释,以鉴定替代性的 PEP 通路。系统发育分析使得能够将 S. copri 分离株有效分类为物种和亚种簇。将核苷酸和蛋白质序列同源性与对照株 S. copri DSM 18205 进行比对分析,以确定替代性磷酸烯醇式丙酮酸合成通路的保守程度。 在 S. copri 菌株 JCM 13468、LKV-178-WT-2C、RHA03、RHA01 和 RHA02 中未鉴定到烯醇化酶(eno);而这些菌株的全基因组系统发育分组提示,S. copri 中可能存在一个 eno(-) 亚种。本研究通过鉴定来源于甲酸、铁氧还蛋白和延胡索酸的替代性 PEP 通路,进一步支持了这一观点,而这些通路在 eno(-) S. copri 基因组中表现出最高的保守性。 本研究为解释为何烯醇化酶可能不存在于 eno(-) S. copri 分离株中提供了理论依据,并表明这些替代性 PEP 合成通路可能抵消细胞对烯醇化酶的需求,同时可能是 S. copri 代谢演化中的一个因素。

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新型烯醇化酶阴性 Segatella copri 亚种的鉴定支持了这样一种观点:Segatella copri 可通过替代性磷酸烯醇式丙酮酸合成途径发生物种分化

Luke Michael Bosnar, Anya Shindler, Steve Petrovski, Ashley E Franks

doi: https://doi.org/10.64898/2026.06.02.729653

Luke Michael Bosnar 拉筹伯大学 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 该作品依据 CC-BY 4.0 国际许可协议提供。

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发表于 2026 年 6 月 5 日。 下载 PDF 电子邮件

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Luke Michael Bosnar, Anya Shindler, Steve Petrovski, Ashley E Franks

bioRxiv 2026.06.02.729653; doi: https://doi.org/10.64898/2026.06.02.729653

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Luke Michael Bosnar, Anya Shindler, Steve Petrovski, Ashley E Franks

bioRxiv 2026.06.02.729653; doi: https://doi.org/10.64898/2026.06.02.729653


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.02.729653v1?rss=1

🏷️ Segatella copri 肠道菌群 烯醇化酶缺失 替代性PEP合成途径 系统发育分析 物种形成