安第斯病毒测序准备的方法学评估与数据资源

root 提交于 周六, 06/06/2026 - 22:47

摘要

作为支持英国高后果传染病(HCID)框架下分类病原体相关准备工作的一部分,我们此前评估了两种用于安第斯病毒(ANDV)测序的方法:一种是全基因组平铺式扩增子测序方案,另一种是泛病毒杂交捕获方法(TWIST-CVRP)。

鉴于近期暴发事件,我们现公开使用历史性ANDV分离株(智利,1997年)生成的病毒测序数据集。此外,我们还提供了对平铺式扩增子方案性能的评估,并基于与近期发布的暴发株基因组的计算机模拟比较,提出了推荐的引物更新方案。这些数据集旨在支持学术共同体内生物信息学流程的基准测试、验证和优化。

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📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.15.725146v1?rss=1

🏷️ 安第斯病毒 病毒测序 扩增子测序 杂交捕获 引物优化 生物信息学基准