一种以增强子为中心的方法应用于人类免疫系统表观基因组，揭示了巨噬细胞增强子与心血管疾病的关联

复杂疾病同时受遗传因素和环境因素的影响。免疫细胞是与环境发生相互作用的关键介导者，但遗传变异对免疫系统的影响及其如何作用于复杂疾病，尚未得到充分理解。此外，大多数与复杂疾病相关的全基因组关联分析（GWAS）变异位于非编码区，因而难以解释。在本研究中，我们考察了非编码变异与免疫细胞增强子的关联。作为 BLUEPRINT 和国际人类表观基因组联盟（IHEC）的一部分，我们生成人并分析了一套全面的人类原代免疫细胞表观基因组数据集，其中包括覆盖 24 种细胞类型、来源于 749 个 ChIP-Seq 实验的 107 个表观基因组。我们鉴定了全基因组范围内跨多种细胞的增强子活性模式，并检验了这些模式与来自 518 种 GWAS 性状的非编码变异之间的联系。该分析揭示了 117 个显著关联，其中包括心血管疾病变异与巨噬细胞特异性增强子之间的新型联系；这些增强子调控参与脂质代谢和免疫过程的基因，例如编码核受体 LXR-α（NR1H3）的基因及其许多已知靶基因。总体而言，这些数据将有助于更好地理解遗传变异对免疫功能及相关疾病的影响。

复杂疾病同时受到遗传因素和环境因素的影响。免疫细胞是介导机体与环境相互作用的关键成分，但遗传变异对免疫系统的影响及其如何作用于复杂疾病仍未得到充分理解。此外，多数与复杂疾病相关的全基因组关联分析（GWAS）变异位于非编码区域，因而难以解释。在本研究中，我们考察了非编码变异与免疫细胞增强子的关联。

作为 BLUEPRINT 和国际人类表观基因组联盟（IHEC）的一部分，我们构建并分析了一套全面的人类原代免疫细胞表观基因组数据集，其中包括来自 24 种细胞类型、基于 749 次 ChIP-Seq 实验获得的 107 个表观基因组。我们鉴定了全基因组范围内跨多种细胞的增强子活性模式，并研究了其与 518 种 GWAS 性状中非编码变异的联系。该分析揭示了 117 个显著关联，其中包括心血管疾病变异与巨噬细胞特异性增强子之间的新关联，这些增强子调控参与脂质代谢和免疫的基因，如编码核受体 LXR-alpha（NR1H3）的基因及其许多已知靶基因。总体而言，这些数据将有助于更好地理解遗传变异性对免疫功能及相关疾病的影响。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.02.728745v1?rss=1

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