深度学习引导的用于晶态PET解聚的水解酶设计

root 提交于 周六, 06/06/2026 - 06:47
聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)是一种广泛用于包装和纺织品的聚酯,由于其高结晶度和高稳定性而在环境中持久存在,因而对全球塑料污染作出了重要贡献。PET水解酶(PETase)介导的酶促解聚为将PET转化为其单体构件、从而实现回收利用,提供了一条化学精确且环境可持续的途径。然而,其实际应用仍受到PET刚性结晶结构的阻碍,该结构限制了酶的可及性,并需要高能耗的预处理才能实现高效解聚。此外,大多数PETase只能实现部分解聚,对苯二甲酸(TPA)产率较低,并会积累具有抑制作用的中间产物;与此同时,有限的热稳定性和缓慢的表面动力学进一步限制了其效率。为克服这些障碍,我们报道了VenusPETase,这是利用PETase工程化前沿计算框架PET-Flow设计的KbPETase工程变体。与KbPETase相比,VenusPETase的水解活性提高了3.4倍,在蛋白经热处理后最高可提高27倍,热稳定性提高了12摄氏度。VenusPETase在50摄氏度下可在广泛的结晶度范围(8%–50%)内实现快速降解,能够有效覆盖商业PET产品的全部结晶度谱。此外,VenusPETase在各自最优条件下优于九种高性能PETase,并能够降解结晶度为8%–50%的未经处理PET底物;其释放产物中TPA占比超过95%,且中间产物积累极少。X射线晶体学和分子动力学模拟表明,动态调控以及升高的表面静电势增强了VenusPETase与结晶PET的相互作用,从而降低了水解能垒并提升了催化性能。我们还证明,来自九种不同产品的未经处理消费后PET均可被VenusPETase降解。回收得到的单体可直接重新聚合为原生品质的PET,展示了一个闭环酶促回收过程。在100 L生物反应器中,VenusPETase在50摄氏度下可于24小时内完全解聚消费后结晶PET(结晶度28%)。这些结果确立了VenusPETase作为一种稳健生物催化剂的地位,可在温和条件下实现结晶PET的高效闭环回收。

聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)是一种广泛用于包装和纺织品的聚酯,由于其高结晶度和高稳定性而在环境中持久存在,因而对全球塑料污染作出了重要贡献。PET水解酶(PETase)介导的酶促解聚为将PET转化为其单体构件、从而实现回收利用,提供了一条化学精确且环境可持续的途径。然而,其实际应用仍然受到PET刚性高、结晶性强的结构所阻碍,这种结构限制了酶的可及性,并且需要高能耗的预处理以实现高效解聚。此外,大多数PETase仅能实现部分解聚,对苯二甲酸(TPA)产率较低,并且会积累具有抑制作用的中间体;与此同时,有限的热稳定性和缓慢的表面反应动力学进一步限制了其效率。为克服这些障碍,我们报道了VenusPETase,这是一种利用PETase工程化前沿计算框架PET-Flow设计得到的KbPETase工程变体。与KbPETase相比,VenusPETase的水解活性提高了3.4倍,经蛋白热处理后最高可提高27倍,热稳定性提升了12摄氏度。VenusPETase在50摄氏度下可在较宽结晶度范围(8%–50%)内实现快速降解,因而有效覆盖了商业PET产品的整个结晶度谱。此外,在各自最优条件下,VenusPETase的性能优于9种高性能PETase,并且能够降解结晶度为8%–50%的未经处理PET底物,所释放产物中TPA占比超过95%,且中间体积累极少。X射线晶体学和分子动力学模拟表明,动态调控以及升高的表面静电势增强了VenusPETase与结晶PET之间的相互作用,从而降低了水解能垒并提升了催化性能。我们还证明,来自9种不同产品的未经处理的消费后PET均可被VenusPETase降解。回收得到的单体可直接重新聚合为原生品质的PET,表明该方法实现了闭环酶法回收过程。在100 L生物反应器中,VenusPETase可在50摄氏度条件下于24小时内将消费后结晶PET(结晶度28%)完全解聚。这些结果确立了VenusPETase作为一种稳健生物催化剂的地位,其能够在温和条件下实现结晶PET的高效闭环回收。


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.04.730138v1?rss=1

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