何时能够基于汇总统计量可靠地估计全基因组 SNP 遗传力？

LD Score Regression（LDSC）是一种重要的方法，它通过对与目标性状相对应的GWAS检验统计量与LD评分进行线性回归，并利用其斜率从汇总统计量中估计全基因组SNP遗传力。LDSC的作者曾声称，回归中的自由截距能够校正诸如群体分层等混杂偏倚。在本研究中，我们认为，为了准确估计SNP遗传力，LDSC中的截距必须固定为1。我们通过理论分析和模拟研究表明，所估计的截距并不能准确捕捉群体分层效应；相反，它会通过引入偏倚并增大方差而损害遗传力估计的准确性。当不存在群体分层时，将截距固定为1可以消除偏倚并降低方差。另一方面，在存在群体分层的情况下，无论截距是自由估计还是固定，LDSC都会产生偏倚。此外，我们还表明，LDSC中的标准误估计被低估，这可能导致后续GWAS分析中出现假阳性。

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🏷️ GWAS LDSC SNP遗传力 汇总统计量 群体分层 方法偏倚