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衣原体门（Chlamydiota）是已在蛇类泄殖腔微生物群中检测到的专性胞内细菌，但其生物学意义仍知之甚少。其成员范围广泛，既包括已被认可的病原体，如蛇衣原体（Chlamydia serpentis），也包括潜在的环境共生体，这引发了关于它们究竟是短暂污染物、持续定殖者，还是亚临床感染因子的疑问。尽管泄殖腔是蛇类排出衣原体的主要部位，但其与更广泛的泄殖腔微生物群之间的相互作用仍未得到探索。 在对来自5个饲养群体的137条圈养蛇进行泛衣原体门PCR筛查后，经V3-V4区16S rRNA测序和质量过滤，保留了52份样本（新蛇类）（27份衣原体门阳性，25份衣原体门阴性）用于分析。衣原体门的存在与α多样性或整体群落组成的显著差异无关，但与群落内部组成异质性的增加相关。差异丰度分析和多变量分析鉴定出若干富集和缺失的属，其中Lachnospiraceae和Copromonas在全部三种方法中均与衣原体门呈稳定负相关。 共现网络分析表明，在存在衣原体门时，可恢复出更多关联以及更高比例的正相关边，同时伴随厌氧类群的扩张。推断的功能组成在组间整体上并无差异；然而，弹性网络稳定性选择识别出细微的通路特异性差异，包括感染蛇类中蛋白水解相关通路和分枝杆菌相关通路的富集。我们的研究结果提示，感染相关的群落变化较为细微，且并不完全符合既有的哺乳动物范式——在该范式中，衣原体属物种通常表现为胃肠道共生菌或宫颈阴道病原体。这凸显了在更大规模的新蛇类和原蛇类野生及圈养群体中采用多组学方法的必要性，以更好地表征这些关联的机制基础及其可推广性。
衣原体门（Chlamydiota）是已在蛇类泄殖腔微生物群中检测到的专性胞内细菌，但其生物学意义仍知之甚少。该类群成员范围广泛，既包括已被确认的病原体，如蛇衣原体（Chlamydia serpentis），也包括潜在的环境共生体，这引发了关于它们究竟是短暂污染物、持续定植者，还是亚临床感染因子的疑问。尽管泄殖腔是蛇类排出衣原体的主要部位，但其与更广泛的泄殖腔微生物群之间的相互作用仍未得到探索。
在对来自5个饲养群体的137条圈养蛇进行泛衣原体门PCR筛查后，经V3-V4区16S rRNA测序和质量过滤，最终保留了52份样本（游蛇类蛇类样本）（27份衣原体门阳性，25份衣原体门阴性）用于分析。衣原体门的存在与α多样性或整体群落组成的显著差异无关，但与群落内部组成异质性的增加相关。差异丰度分析和多变量分析鉴定出若干富集和耗竭的属，其中Lachnospiraceae和Copromonas在全部三种方法中均与衣原体门呈稳定负相关。共现网络分析表明，在存在衣原体门时可恢复更多关联，且正相关边所占比例更高，同时伴随着厌氧类群的扩张。推断的功能组成在组间整体上并无差异；然而，弹性网络稳定性选择识别出细微的通路特异性差异，包括感染蛇中蛋白水解通路和分枝杆菌相关通路的富集。
我们的研究结果提示，与感染相关的群落变化较为细微，且并不完全符合既有的哺乳动物范式；在这些范式中，衣原体属物种要么表现为胃肠道共生菌，要么表现为宫颈阴道病原体。这一发现凸显了在更大规模的游蛇类和蚺蛇类野生及圈养蛇群体中采用多组学方法的必要性，以更好地表征这些关联的机制基础及其可推广性。
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.04.730152v1?rss=1
🏷️ 蛇类泄殖腔微生物群 衣原体门 16S rRNA测序 共现网络分析 群落异质性 圈养蛇