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G-四链体(G4)是含有鸟嘌呤四聚体的非经典DNA二级结构,对癌症、神经退行性疾病及其他遗传疾病具有深远意义;然而,其预测结果需要通过依赖仪器的实验方法加以验证,包括圆二色(CD)光谱、荧光检测、核磁共振(NMR)或晶体学。我们报道了一种新型、低成本、高效且可扩展的双酶体系,用于确认G4形成及拷贝数重复次数。首先是QuadCleave,其中采用错配核酸内切酶I,对仅含G4形成序列的寡脱氧核苷酸进行可重复、位点特异且选择性的切割。其次,HaeIII酶可鉴定同时也能形成GG/CC碱基对的G4形成序列,而某一序列可被两者共同切割,则据此在C9ORF72中确立该序列;C9ORF72是肌萎缩侧索硬化症(ALS)和额颞叶痴呆(FTD)中突变最为频繁的基因。这些发现确立了一种普遍可及的实验验证方法,用于验证G4形成序列及评估其拷贝数重复,尤其适用于C9ORF72寡脱氧核苷酸;其重复扩增在部分ALS和FTD患者中具有关键的临床意义。
该研究已向美国专利商标局(USPTO)提交专利申请,申请号为美国专利申请第63/966,755号。
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📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.15.725486v1?rss=1
🏷️ DNA G-四链体 酶切检测 C9orf72重复扩增 ALS/FTD 核酸二级结构
来源出处
QuadCleave:DNA G-四链体的酶切与分析
https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.15.725486v1?rss=1