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单细胞转录组学数据所预测的细胞类型多样性高于此前认识,其定义基础是组合式基因表达“编码”。这些编码可支持交叉靶向策略,用于选择性标记和操纵预测的细胞类型,从而促进通过功能性检验解析细胞特异性作用,并进一步完善细胞类型定义。其中一种方法是将二元表达系统(例如 Gal4/UAS 和 QF/QUAS)的驱动组分切分为两个相互依赖的半部分,即激活结构域(AD)和 DNA 结合结构域(DBD)。这些“分裂驱动子”(split-drivers,又称 hemidrivers)的转录活性仅在共表达二者的细胞中才会被重建。尽管该系统已在无脊椎动物中得到广泛应用,但在脊椎动物中尚未被系统性部署。在此,我们通过直接报告基因融合或 2A 病毒肽共表达系统,开发了一系列带有荧光标记的 split-QF 和 QF2 hemidrivers。荧光标记可用于:1)简化 hemidriver 转基因品系的构建与维持;2)实现 AD 和 DBD 交集表达的直接可视化;3)支持对靶向效能和脱靶活性的稳健质量控制评估。这些资源可提高转基因靶向的特异性,从而支持对单细胞转录组学揭示的细胞类型进行功能解析。
荧光标记的 split-QF 半驱动子:简化并增强实现离散细胞类型交叉靶向的方法 | bioRxiv
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荧光标记的 split-QF 半驱动子:简化并增强实现离散细胞类型交叉靶向的方法
查看 ORCID 个人资料 Lydia G Sanders, 查看 ORCID 个人资料 Grant Kroeschell, 查看 ORCID 个人资料 Anneliese Ceisel, Caroline E Clouatre, Yiqi Gao, Gianna Graziano, Diego Alfaro Carcoba, Claire Deng, Catalina Rodriguez, James H Thierer, 查看 ORCID 个人资料 Jeff S Mumm
doi: https://doi.org/10.64898/2026.06.01.729389
Lydia G Sanders 约翰斯·霍普金斯大学 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。
本文依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议 提供。
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发布于 2026 年 6 月 4 日。 下载 PDF 补充材料 数据/代码 电子邮件
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Lydia G Sanders, Grant Kroeschell, Anneliese Ceisel, Caroline E Clouatre, Yiqi Gao, Gianna Graziano, Diego Alfaro Carcoba, Claire Deng, Catalina Rodriguez, James H Thierer, Jeff S Mumm
bioRxiv 2026.06.01.729389; doi: https://doi.org/10.64898/2026.06.01.729389
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荧光标记的 split-QF 半驱动子:简化并增强实现离散细胞类型交叉靶向的方法
Lydia G Sanders, Grant Kroeschell, Anneliese Ceisel, Caroline E Clouatre, Yiqi Gao, Gianna Graziano, Diego Alfaro Carcoba, Claire Deng, Catalina Rodriguez, James H Thierer, Jeff S Mumm
bioRxiv 2026.06.01.729389; doi: https://doi.org/10.64898/2026.06.01.729389
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.01.729389v1?rss=1
🏷️ split-QF系统 荧光标记 交叉靶向 单细胞转录组学 转基因工具 细胞类型特异性