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哺乳动物的双链RNA(dsRNA)传感器在检测到dsRNA后,可协调引发一系列细胞反应,包括翻译抑制、RNA降解和干扰素诱导。哺乳动物细胞中的细胞质内源性或外源性dsRNA可凝聚形成细胞质核糖核蛋白复合体,称为dsRNA诱导灶(dRIFs),其中富集了包括OAS3和PKR在内的部分dsRNA传感器。然而,dRIFs的蛋白质组成及其对dsRNA反应调控的影响尚未得到充分理解。为确定dRIFs的其他组分,我们在体外重构了dRIFs,并通过质谱分析其组成。我们鉴定并验证了多个新的dRIF组分,包括在先天免疫、转录调控和蛋白质稳态中发挥作用的dsRNA结合蛋白以及经典RNA结合蛋白。此外,我们鉴定到在有丝分裂期间形成且组成发生改变的dRIFs。对dRIFs的功能研究表明,DHX9是dRIF形成的限制性因素,而驻留于dRIF中的蛋白ZNF346则是PKR信号传导的调节因子。
roy.parker{at}colorado.edu
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摘要
哺乳动物 dsRNA 传感器在检测到 dsRNA 后会协调一系列细胞反应,包括翻译抑制、RNA 降解和干扰素诱导。在哺乳动物细胞中,细胞质内源性或外源性 dsRNA 可凝聚形成细胞质核糖核蛋白复合体,称为 dsRNA 诱导灶(dRIFs),其中富集了包括 OAS3 和 PKR 在内的部分 dsRNA 传感器。然而,dRIFs 的蛋白质组成及其对 dsRNA 反应调控的影响仍知之甚少。为确定 dRIFs 的其他组分,我们在体外重构了 dRIFs,并通过质谱分析其组成。我们鉴定并验证了多个新的 dRIF 组分,包括在先天免疫、转录调控和蛋白质稳态中发挥作用的 dsRNA 结合蛋白以及经典 RNA 结合蛋白。此外,我们还鉴定到在有丝分裂期间形成且组成发生改变的 dRIFs。对 dRIFs 的功能研究表明,DHX9 是 dRIF 形成的限制性因子,而 dRIF 驻留蛋白 ZNF346 是 PKR 信号传导的调节因子。
利益冲突声明
R.P. 是 Illumen Therapeutics 的联合创始人/顾问,并且是 Ascidian Therapeutics 科学顾问委员会成员。
脚注
https://proteomecentral.proteomexchange.org/ui?pxid=PXD053100
已声明资助信息
霍华德·休斯医学研究所, https://ror.org/006w34k90
版权
本预印本的。
本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议 发布。
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发布于 2026 年 6 月 4 日。
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dRIF 组成分析鉴定 ZNF346 为 PKR 激活的调节因子
Gaia
Loucas
,
Roy
Parker
bioRxiv
2026.06.03.729416;
doi:
https://doi.org/10.64898/2026.06.03.729416
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dRIF 组成分析鉴定 ZNF346 为 PKR 激活的调节因子
Gaia
Loucas
,
Roy
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2026.06.03.729416;
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https://doi.org/10.64898/2026.06.03.729416
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.03.729416v1?rss=1
🏷️ 双链RNA dRIF PKR激活 ZNF346 先天免疫 质谱分析