严重种群瓶颈后由多基因负荷导致的近交衰退

尽管严重近交会带来不利影响，但种群如何在极端瓶颈后得以存续，仍然知之甚少。我们利用37年的个体基础监测数据和180万个SNP，研究了曾一度处于极危状态的塞舌尔莺（Acrocephalus sechellensis）中近交的基因组结构。连锁不平衡模式显示，其历史有效种群大小约为270，而在与人类殖民塞舌尔群岛事件相吻合的时期骤降至约13。 当代基因组中，超过三分之一的基因组区域因近期近交而处于近交状态，这通过自人类殖民塞舌尔以来50代内形成的纯合区段（ROH）得到测量（50代以内的平均FROH = 0.38）；同时，我们在多个关键适合度性状中识别出显著的近交衰退。平均而言，个体近交水平每增加10%，寿命缩短17.9%，终生产仔数减少15.1%。 全基因组扫描表明，这种衰退由多基因遗传负荷所致。我们的结果提示，小种群规模的历史可能促进了严重遗传负荷的选择性清除，而轻度有害等位基因则通过遗传漂变逃逸了选择。遗传负荷的分层结构可能使该物种尽管在接近灭绝后经历了近交衰退，仍得以实现种群恢复。

尽管存在严重的近交，种群如何在极端瓶颈中存活下来，仍然知之甚少。我们利用37年的个体水平监测数据和180万个SNP，研究了曾一度极危的塞舌尔莺（Acrocephalus sechellensis）近交的基因组结构。连锁不平衡模式显示，其历史有效种群大小约为270，而在与人类殖民塞舌尔群岛事件相一致的时期骤降至约13。基于纯合片段（ROH）测量，当前基因组中超过三分之一的部分因近期近交而呈现近交状态，这些ROH形成于人类殖民塞舌尔以来的50代之内（平均FROH

我们的结果表明，长期的小种群规模历史可能促进了严重遗传负荷的选择性清除，而轻度有害等位基因则通过遗传漂变逃避了选择。遗传负荷的分区结构可能使该物种尽管在濒临灭绝后经历了近交衰退，仍得以实现种群恢复。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.03.729877v1?rss=1

🏷️ 近交衰退 种群瓶颈 多基因遗传负荷 纯合区段 全基因组SNP 塞舌尔莺