种猪运输推动了猪甲型流感病毒在欧洲的传播

猪是既往人源甲型流感病毒（IAV）H1N1和H3N2谱系的储存宿主，并作为多种毒株的“混合容器”，促进新型IAV的产生。因此，理解猪甲型流感病毒（swIAV）的传播与演化，对于评估具有人畜共患潜力毒株的出现风险至关重要。本研究采用系统地理学框架，探究欧洲范围内swIAV传播的预测因素。研究获取了所有公开可用的swIAV基因组序列，并针对欧洲十大生猪生产国进行了重抽样。对编码H1、H3、N1、N2的基因以及所有内部基因片段开展了离散系统地理重建。我们的分析表明，病毒传播主要由欧洲西北部向南部和东部发生，且非邻接国家之间存在频繁的长距离传播事件。 我们还将广义线性模型扩展应用于离散系统地理分析，以检验病毒传播与潜在预测因素之间的关联，例如活猪贸易、猪肉贸易、猪群密度、养殖场规模，或关键生猪生产区之间的地理距离。我们发现，种猪贸易是唯一在国家间传播事件中得到持续且有力支持的预测因素，而猪肉贸易和地理距离则未获得支持。这表明，从多个国家进口种猪的养殖场可能成为多样化swIAV毒株发生基因重配的热点。通过加强养殖场外部生物安全，重点对种猪实施隔离、限制长距离运输，并建立“同一健康”（One Health）监测体系以更早发现新发毒株，或可有助于遏制swIAV在欧洲的快速传播与演化。

猪是既往人源甲型流感病毒（influenza A virus, IAV）H1N1和H3N2谱系的储存宿主，并作为多种毒株的“混合容器”，促进新型IAV的出现。因此，理解猪甲型流感病毒（swine IAVs, swIAVs）的传播与演化，对于评估具有人畜共患潜力毒株出现的风险至关重要。本研究采用系统地理学框架，探讨影响swIAV在欧洲扩散的预测因素。我们检索了所有公开可得的swIAV基因组序列，并针对欧洲十大生猪生产国进行了子样本抽取。随后，对编码H1、H3、N1、N2的基因以及所有内部基因片段进行了离散系统地理重建。我们的分析表明，病毒传播主要由欧洲西北部向南部和东部发生，且非相邻国家之间频繁出现长距离迁移事件。

我们还将离散系统地理分析与广义线性模型相结合，以检验病毒传播与潜在预测因素之间的关联，例如活猪贸易、猪肉贸易、猪群密度、农场规模，或主要生猪生产区之间的地理距离。研究发现，种猪贸易是唯一一个在国家间迁移事件中得到持续且有力支持的预测因素，而猪肉贸易和地理距离则未获得支持。这表明，从多个国家进口种猪的农场可能成为多样swIAV毒株发生重配的热点。加强农场外部生物安全，重点对种猪实施隔离、限制长距离运输，并建立“One Health”监测体系以更早发现新出现的毒株，可能有助于遏制swIAV在欧洲的快速传播与演化。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.01.729471v1?rss=1

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