CellClick：用于单细胞与空间组学数据中可调且精确细胞类型注释的交互式平台

单细胞组学和空间组学技术如今已被广泛应用于生物学和医学研究。在单细胞组学与空间组学数据分析中，准确的细胞类型注释是开展下游分析和获得科学发现的关键步骤。然而，高质量的细胞注释通常需要经过多轮人工分析以不断优化结果，这给大多数研究人员带来了巨大挑战。在此，我们提出了 CellClick，这是一个用于单细胞和空间组学数据中便捷且准确进行细胞类型注释的交互式平台。CellClick 提供了数据预处理、数据可视化、细胞注释、注释验证和细胞重新注释等模块，可支持自动或用户引导的细胞选择与注释。我们通过 scRNA-seq 和空间转录组数据的实例，展示了使用 CellClick 生成更准确细胞注释结果的可行性。

单细胞组学和空间组学技术如今已广泛应用于生物学和医学研究。在单细胞组学和空间组学数据分析中，准确的细胞类型注释是开展下游分析和获得科学发现的关键步骤。然而，高质量的细胞注释通常需要经过多轮人工分析以优化结果，这给大多数研究人员带来了巨大挑战。

在此，我们提出了 CellClick，一个用于单细胞组学和空间组学数据中便捷且准确进行细胞类型注释的交互式平台。CellClick 提供了数据预处理、数据可视化、细胞注释、注释验证和细胞重新注释等模块，支持自动或用户引导的细胞选择与注释。利用 scRNA-seq 数据和空间转录组数据的实例表明，CellClick 可用于生成更加准确的细胞注释结果。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.01.727775v1?rss=1

🏷️ 单细胞组学 空间组学 细胞类型注释 交互式平台 空间转录组 scRNA-seq