- 3 次围观
数据非依赖性采集（DIA）蛋白质组学几乎完全依赖束型碰撞诱导解离（HCD），因为其较短的活化时间能够支持DIA所需的快速采集速率。然而，HCD需要进行电荷态校准，因此对于混合电荷态的DIA隔离窗口而言并不完美。共振激发碰撞诱导解离（reCID）为DIA提供了一个有前景的HCD替代方案，因为其离子活化在实际上基本不依赖于电荷态。历史上，reCID较长的活化时间一直被认为对于DIA而言过于缓慢。在本研究中，我们利用一台经过改造的Orbitrap Tribrid Apex MultiOmics质谱仪（Apex）重新评估了reCID在DIA蛋白质组学中的应用。该仪器可将采集矩阵的额外开销回收为额外的离子注入时间，从而使reCID的采集速率可与HCD相当。在对胰蛋白酶消化的HeLa样品进行匹配采集速率设置的条件下，当结合使用经Carafe精细调优、与碎裂方式匹配的谱库时，reCID在前体离子和蛋白鉴定数量上达到了与HCD相似的水平。谱库精细调优对reCID前体离子检出的提升幅度大于对HCD检出的提升，分别为24%和5%，这表明基于HCD训练的预测模型对于reCID谱图并非最优。reCID还保持了肽段水平的定量性能，包括每条肽段测得的离子数、精密度和准确度。在7种NCI癌症细胞系及其混合样品中，Apex平台上reCID与HCD方法所得的蛋白丰度排序高度一致，并且在Orbitrap Astral Zoom平台之间也表现出高度一致性。这些结果表明，reCID可作为DIA蛋白质组学中一种实用的碎裂模式。
重新审视用于数据非依赖性采集的共振激发碰撞诱导解离 | bioRxiv
跳转至主要内容 首页 关于 投稿 提醒 / RSS 搜索此关键词 高级搜索 新结果
重新审视用于数据非依赖性采集的共振激发碰撞诱导解离
Chris Hsu， Lilian R Heil， Bo Wen， Graeme C McAlister， Gennifer E. E Merrihew， Philip Remes， Deanna L Plubell， Rafael D Melani， Vlad Zabrouskov， Michael J. MacCoss
doi： https://doi.org/10.64898/2026.05.31.729078
Chris Hsu 1 华盛顿大学； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议公开提供。
查看讨论主题。
返回顶部 上一项 下一项
发表于 2026 年 6 月 3 日。
下载 PDF 补充材料 电子邮件
感谢您有兴趣帮助传播 bioRxiv 的内容。 您的电子邮件 *
您的姓名 *
发送至 *
请输入多个地址，每行一个，或以逗号分隔。
您将发送以下内容 重新审视用于数据非依赖性采集的共振激发碰撞诱导解离
消息主题 （您的姓名）已从 bioRxiv 转发一个页面给您
消息正文 （您的姓名）认为您可能希望查看 bioRxiv 网站上的此页面。
您的个人留言
验证码
此问题用于测试您是否为人工访客，并防止自动垃圾信息提交。
分享
重新审视用于数据非依赖性采集的共振激发碰撞诱导解离
Chris Hsu， Lilian R Heil， Bo Wen， Graeme C McAlister， Gennifer E. E Merrihew， Philip Remes， Deanna L Plubell， Rafael D Melani， Vlad Zabrouskov， Michael J. MacCoss
bioRxiv 2026.05.31.729078； doi： https://doi.org/10.64898/2026.05.31.729078
分享本文： 复制
引文工具
重新审视用于数据非依赖性采集的共振激发碰撞诱导解离
Chris Hsu， Lilian R Heil， Bo Wen， Graeme C McAlister， Gennifer E. E Merrihew， Philip Remes， Deanna L Plubell， Rafael D Melani， Vlad Zabrouskov， Michael J. MacCoss
bioRxiv 2026.05.31.729078； doi： https://doi.org/10.64898/2026.05.31.729078
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.31.729078v1?rss=1
🏷️ 蛋白质组学 数据非依赖采集 质谱分析 碰撞诱导解离 碎裂模式