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肾纤维化是慢性肾脏病（CKD）的共同终末通路，其部分由肌成纤维细胞介导的细胞外基质沉积所驱动。M2巨噬细胞被认为可通过巨噬细胞向肌成纤维细胞转分化（macrophage-to-myofibroblast transition, MMT）成为肌成纤维细胞的来源，然而M2巨噬细胞究竟具有促纤维化还是抗纤维化作用仍存在争议，而且MAC-M2-纤维化耦合发生的空间背景尚不明确。在本研究中，我们将地理加权回归（GWR）这一空间统计学方法应用于糖尿病肾病（DKD）的Visium空间转录组数据，以刻画空间分辨的高耦合点位，即MAC-M2-纤维化耦合显著为正的区域。在一个小规模DKD队列（n=6）中，GWR鉴定出富集B细胞/三级淋巴结构（TLS）样免疫特征的高耦合点位，从而支持了该分析框架的生物学相关性。为提高差异表达基因（DEG）分析的统计效能，我们随后将相同流程应用于更大规模的肾脏精准医学项目（KPMP）DKD队列（n=30），结果显示高耦合点位中IgE相关免疫基因（IGHE、FCER1A）以及肥大细胞类胰蛋白酶TPSB2上调。这些发现提示，在以局部MAC-M2-纤维化耦合为特征的DKD纤维化微环境中，可能存在IgE相关免疫反应。作为疾病比较，我们进一步将该流程应用于KPMP高血压性肾病（HKD）队列（n=27），其中高耦合点位的特征与DKD不同，且未见IgE相关基因富集。综上，本研究首次将GWR应用于肾脏空间转录组学，并提示IgE相关免疫反应可能是DKD纤维化微环境的一个特征，在此类微环境中M2巨噬细胞在局部与纤维化相关联。
将空间统计学应用于空间转录组学揭示糖尿病肾病中 M2 样巨噬细胞与纤维化之间的局部关联 | bioRxiv
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将空间统计学应用于空间转录组学揭示糖尿病肾病中 M2 样巨噬细胞与纤维化之间的局部关联
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Kanako Terakawa， Hideaki Kawaguchi， Masaomi Nangaku， Imari Mimura
doi： https://doi.org/10.64898/2026.05.31.729068
Kanako Terakawa 1 东京大学； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 许可，允许其永久展示该预印本。 保留所有权利。未经许可不得转载或再利用。
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发布于 2026 年 6 月 3 日。
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将空间统计学应用于空间转录组学揭示糖尿病肾病中 M2 样巨噬细胞与纤维化之间的局部关联
Kanako Terakawa， Hideaki Kawaguchi， Masaomi Nangaku， Imari Mimura
bioRxiv 2026.05.31.729068； doi： https://doi.org/10.64898/2026.05.31.729068
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将空间统计学应用于空间转录组学揭示糖尿病肾病中 M2 样巨噬细胞与纤维化之间的局部关联
Kanako Terakawa， Hideaki Kawaguchi， Masaomi Nangaku， Imari Mimura
bioRxiv 2026.05.31.729068； doi： https://doi.org/10.64898/2026.05.31.729068
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.31.729068v1?rss=1
🏷️ 空间转录组学 糖尿病肾病 M2样巨噬细胞 肾纤维化 地理加权回归 IgE免疫反应