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尽管转座元件（TEs）被认为是真菌基因组结构的重要驱动因素，但关于其直接参与与宿主植物及环境相互作用的证据才刚刚开始显现。反转座子能够产生小RNA（sRNA），其可通过跨界RNA干扰发挥作用；而被称为“Starships”的巨型DNA转座元件则携带数十个货载基因，从而丰富了真菌基因组中的附属基因组成分。 在广食性病原菌灰葡萄孢（Botrytis cinerea）中，Vv3菌株及其他专化于葡萄的菌株表现出一套特异性的转座元件谱系，其中包括反转座子BcCopia4、BcGypsy6和BcGypsy7。本研究首先探讨了这些反转座子产生的sRNA在Vv3菌株与其原始宿主葡萄相互作用中的潜在作用。在宿主mRNA中鉴定出了推定靶标，但预测的切割位点无法通过实验验证。此外，无法产生来源于反转座子的sRNA的Dicer突变体在葡萄上仍保持完全致病性，这表明这些sRNA并不作为该宿主上的毒力因子发挥作用。 与此同时，本研究基于RNA-seq对Vv3菌株附属基因进行了更新注释，揭示出一个新的93 kb大小的Starship，其携带43个货载基因，其中一些与抗砷性相关。正式遗传学方法证实，该位点赋予了对这种类金属元素的抗性。这一被命名为Ariane的巨型转座元件，也在其他对砷具有抗性的葡萄专化菌株中被检测到，但在来自番茄等其他宿主的分离株中未见检出。 总之，本研究强调了Starship巨型转座子如何塑造广食性真菌灰葡萄孢的附属基因组成分，并且可能通过赋予对砷的抗性促进其对葡萄栽培环境的适应；砷是一种在上个世纪葡萄园中被广泛使用的化合物。
尽管转座元件（TEs）被认为是真菌基因组结构的主要驱动因素，但其直接参与与宿主植物及环境相互作用的证据才刚开始显现。逆转座子能够产生小RNA（sRNA），并通过跨界RNA干扰发挥作用；而被称为 Starships 的巨型DNA转座元件则携带数十个货物基因，从而丰富了真菌基因组中的附属基因组分。
在广食性病原菌灰葡萄孢（Botrytis cinerea）中，Vv3菌株及其他专化于葡萄的菌株表现出特异性的转座元件谱，包括逆转座子 BcCopia4、BcGypsy6 和 BcGypsy7。本研究首先探讨了这些逆转座子产生的 sRNA 在 Vv3 菌株与其原始宿主葡萄相互作用中的潜在作用。在宿主 mRNA 中鉴定出了推定靶标，但预测的切割位点无法通过实验验证。此外，无法产生来源于逆转座子的 sRNA 的 Dicer 突变体在葡萄上仍保持完全致病性，这表明这些 sRNA 在该宿主上并不作为毒力因子发挥作用。
与此同时，本研究还基于 RNA-seq 对 Vv3 菌株的附属基因进行了更新注释，揭示出一个新的 93 kb 的 Starship，其携带 43 个货物基因，其中部分与砷抗性相关。正式遗传学方法证实，该位点赋予了对这种类金属元素的抗性。这一被命名为 Ariane 的巨型转座元件还在其他对砷具有抗性的葡萄专化菌株中被检测到，但未在分离自番茄等其他宿主的菌株中发现。
总之，本研究强调了 Starship 巨型转座子如何塑造广食性真菌灰葡萄孢的附属基因组分，并且其可能通过赋予对砷的抗性而促进了该菌对葡萄栽培环境的适应；砷是上个世纪葡萄园中被广泛使用的一种化合物。
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.30.728154v1?rss=1
🏷️ 转座子 灰葡萄孢菌 小RNA Starship巨型转座子 宿主专化 抗砷性