组蛋白琥珀酰化直接抑制Jumonji结构域去甲基化酶并稳定抑制性染色质状态

在此，我们揭示了组蛋白琥珀酰化与含 Jumonji（JmjC）结构域的组蛋白去甲基化酶之间的关联。我们采用定量蛋白质组学和肽下拉实验，鉴定出 JmjC 去甲基化酶是与琥珀酰化组蛋白肽相互作用的候选蛋白。琥珀酰赖氨酸肽以剂量依赖性方式结合并抑制 JmjC 去甲基化酶的催化活性。其中包括 KDM4D 和 KDM6B，它们负责去除沉默标记 H3K9me2/3 和 H3K27me2/3。对 HepG2/C3A 细胞进行超生理浓度琥珀酸钠处理后，组蛋白琥珀酰化、H3K9me2/3 和 H3K27me2/3 的相对丰度均升高。CUT&Tag 和 ChIP 质谱分析显示，琥珀酰化与这些抑制性甲基化标记共同存在，并伴随转录输出降低。这项工作建立了代谢物丰度与染色质调控之间一种新的机制性联系，并提示组蛋白琥珀酰化在异染色质维持中具有作用。

在此，我们揭示了组蛋白琥珀酰化与含 Jumonji（JmjC）结构域的组蛋白去甲基化酶之间的关联。我们采用定量蛋白质组学和肽下拉实验，将 JmjC 去甲基化酶鉴定为与琥珀酰化组蛋白肽相互作用的候选蛋白。琥珀酰赖氨酸肽以剂量依赖性方式结合并抑制 JmjC 去甲基化酶的催化活性。这其中包括 KDM4D 和 KDM6B，它们分别负责去除沉默标记 H3K9me2/3 和 H3K27me2/3。以超生理浓度琥珀酸钠处理 HepG2/C3A 细胞后，组蛋白琥珀酰化、H3K9me2/3 和 H3K27me2/3 的相对丰度均增加。CUT&Tag 和 ChIP-质谱分析揭示，琥珀酰化与这些抑制性甲基化标记共同出现，并伴随转录输出降低。该研究建立了代谢物丰度与染色质调控之间一种新的机制性联系，并提示组蛋白琥珀酰化在异染色质维持中发挥作用。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.29.728167v1?rss=1

🏷️ 组蛋白琥珀酰化 JmjC去甲基化酶 表观遗传调控 抑制性染色质 异染色质维持