空间转录组分析揭示英国和日本患者卵巢透明细胞癌及其邻近子宫内膜异位症中的协同基因表达

目的：卵巢透明细胞癌（OCCC）与子宫内膜异位症密切相关，且其发病率存在地域差异。我们研究了OCCC及其邻近的子宫内膜异位症是否表现出不同的转录状态，以及这些模式在英国（UK）和日本队列之间是否存在差异。 实验设计：我们对16例同时存在肿瘤和子宫内膜异位症的OCCC病例（英国8例，日本8例）的标本进行了全转录组空间分析。在肿瘤、子宫内膜异位症和间质中分析了基因表达。ARID1A状态通过免疫组织化学评估。 结果：中位年龄为59岁（范围26–82岁）。16例中有13例（81.3%）为早期疾病。与子宫内膜异位症和肿瘤区域相关的变异中，组织区室而非来源队列是主要来源。与肿瘤相比，子宫内膜异位症中炎症及免疫相关通路富集，而肿瘤区域中染色质以及蛋白质-DNA复合体组装通路的代表性更高。这些模式在两个队列中均得到保留，并且在按ARID1A状态分层后仍然一致。与间充质相关的基因表达评分在间质、子宫内膜异位症和肿瘤之间也存在显著差异，并表现出清晰的区室分离。细胞类型去卷积分析显示，间质与上皮性病变区室之间存在明显的组成差异。 结论：OCCC与共存的子宫内膜异位症在转录水平上存在明显差异，其主导性对比体现在区室层面而非地域层面。仅凭ARID1A不太可能解释本研究所鉴定出的主要空间转录状态。仍需进一步分析以确定，这些差异究竟反映了OCCC与共存子宫内膜异位症之间真实的生物学差异，还是代表了子宫内膜异位症相关肿瘤发生的不同阶段。

目的：卵巢透明细胞癌（OCCC）与子宫内膜异位症密切相关，并且其发病率存在地理差异。我们旨在研究OCCC及其邻近的子宫内膜异位症是否表现出不同的转录状态，以及这些模式在英国（UK）和日本队列之间是否存在差异。

实验设计：我们对16例同时存在肿瘤和子宫内膜异位症的OCCC病例（英国8例，日本8例）进行了全转录组空间分析。在肿瘤、子宫内膜异位症及间质中分析基因表达。ARID1A状态通过免疫组织化学进行评估。

结果：中位年龄为59岁（范围26–82岁）。16例中有13例（81.3%）为早期疾病。与队列来源相比，组织分区是子宫内膜异位症和肿瘤区域间变异的主要来源。与肿瘤相比，子宫内膜异位症中炎症和免疫相关通路富集，而肿瘤区域中染色质及蛋白质-DNA复合体组装通路的代表性更高。这些模式在两个队列中均得到保留，并且在按ARID1A状态分层后仍然一致。与间充质相关的基因表达评分在间质、子宫内膜异位症和肿瘤之间也存在显著差异，并表现出清晰的分区分离。细胞类型去卷积分析显示，间质和上皮性病变分区之间存在明显的组成差异。

结论：OCCC与共存的子宫内膜异位症在转录水平上存在明显差异，其中主导性的对比体现为组织分区差异而非地理差异。ARID1A本身不太可能解释本研究中所识别的主要空间转录状态。仍需进一步分析以确定，这些差异究竟反映了OCCC与共存子宫内膜异位症之间真实的生物学差异，还是代表了子宫内膜异位症相关肿瘤发生的不同阶段。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.29.728698v1?rss=1

🏷️ 空间转录组 卵巢透明细胞癌 子宫内膜异位症 协同基因表达 ARID1A 肿瘤微环境