immgenT CD4：小鼠 CD4+ T 细胞参考图谱

CD4+ T细胞是免疫系统的协调者，具有多样的效应功能。由于缺乏统一的框架，其完整的分子多样性仍不清楚。在 immgenT 项目中，我们对超过700个样本中的常规 CD4+ T细胞进行了 RNA、表面标志物和 TCR 克隆型分析。与联合 RNA-蛋白深度生成模型的整合揭示了由20种 CD4 状态组成的集合，这些状态能够解释不同组织和不同刺激条件下的所有细胞。 少量高度极化的簇（“尖端”）呈现出 Th1、Th2、Th17 和 Tfh 状态特征，与此同时，大多数具有混合程序的活化细胞则占据了“中地”状态。与 CD8+ T细胞不同，记忆性 CD4+ T细胞在很大程度上对应于与效应细胞相同的状态。静息状态被证明具有相当高的多样性，我们还揭示了 Tfh 状态与慢性刺激状态之间出乎意料的相似性。总之，immgenT 为 CD4+ T细胞多样性提供了统一的分子参考。

CD4+ T细胞是免疫系统的协调者，具有多样化的效应功能。由于缺乏统一的框架，其完整的分子多样性仍不清楚。在 immgenT 项目中，我们在超过700个样本中对常规 CD4+ T细胞的 RNA、表面标志物和 TCR 克隆型进行了分析。与联合 RNA-蛋白深度生成模型的整合揭示了由20种 CD4 状态组成的集合，这些状态能够解释跨组织及不同挑战条件下的全部细胞。能够唤起 Th1、Th2、Th17 和 Tfh 状态的小型、高度极化簇（“尖端”）与占多数的、具有混合程序并处于“中地”状态的活化细胞并存。不同于 CD8+ T细胞，记忆性 CD4+ T细胞在很大程度上映射到与效应细胞相同的状态。静息状态被证明具有相当高的多样性，而我们还揭示了 Tfh 与慢性刺激状态之间出人意料的相似性。总体而言，immgenT 为 CD4+ T细胞多样性提供了统一的分子参考。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.29.728553v1?rss=1

🏷️ CD4+T细胞 免疫图谱 单细胞转录组 TCR克隆型 细胞状态异质性