染色体结构蛋白 Su(Hw) 的共享结合位点介导果蝇 TAD 边界之间的物理相互作用

环挤出机制已被明确证明不足以作为解释TAD形成的机制，这使我们对于TAD边界相互作用以及TAD间染色体相互作用的特异性如何被决定的理解留下了巨大空白。许多TAD结合蛋白已被认为参与边界相互作用，其中包括gypsy转座子边界结合蛋白Su(Hw)。这些蛋白如何产生支撑染色体结构的、通常具有特异性且依赖方向性的边界相互作用，在很大程度上仍属未知。 在此，我们研究了位于果蝇eve位点两侧边界homie和nhomie中各自单个Su(Hw)结合位点的作用。我们表明，尽管Su(Hw)在整个果蝇基因组中结合数百个位点，但它在homie和nhomie高度选择性且具有方向特异性的相互作用中发挥了重要作用。尽管它在这些相互作用的结合强度和稳定性方面具有举足轻重的作用，其他边界结合蛋白仍被认为是决定相互作用特异性的主要因素。这些研究提供了一个重要实例，表明有必要更全面地探究在这类重要的基因组结构元件中，TAD边界相互作用的强度与特异性是如何被分别编码的。

环挤出机制已被明确证明不足以解释TAD的形成，这使我们对于TAD边界相互作用以及TAD间染色体相互作用的特异性如何被决定的理解仍存在巨大空白。许多TAD结合蛋白已被认为参与了边界相互作用，其中包括gypsy转座子边界结合蛋白Su(Hw)。这些蛋白如何产生支撑染色体结构的、通常具有特异性且依赖于方向的边界相互作用，在很大程度上仍不清楚。

在此，我们研究了位于果蝇eve位点两侧边界homie和nhomie中的单个Su(Hw)结合位点的作用。我们表明，Su(Hw)虽然在整个果蝇基因组中结合数百个位点，但在homie和nhomie高度选择性且具有方向特异性的相互作用中发挥了重要作用。尽管Su(Hw)在这些相互作用的结合强度和稳定性方面具有突出的作用，但其他边界结合蛋白被认为是决定这些相互作用特异性的主要因素。

这些研究提供了一个重要例证，说明有必要更全面地探究在这一重要的基因组结构元件类别中，TAD边界相互作用的强度与特异性是如何被分别编码的。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.28.727987v1?rss=1

🏷️ 果蝇 TAD边界 染色体结构 Su(Hw) 边界相互作用