果蝇胚胎中母源性与合子基因表达的自然选择模式

早期胚胎发育涉及来自两个不同基因组的基因表达协同作用，因为母体在合子转录开始之前便已向卵中装载基因产物。由于母源转录组受母体的调控基因型而非胚胎自身基因型控制，尽管这两个连续的发育程序都存在于胚胎内部，它们仍可能经历不同的进化约束与选择压力。 为推断母源和合子发育阶段基因表达所受的选择模式，我们采用单胚胎RNA测序，并对热带与温带黑腹果蝇胚胎的亲本及F2分离后代转录组进行了选择方差检验。我们发现，大约10%的母源转录本和5%的合子转录本显示出选择信号。在全基因组范围内，定向选择比稳定化选择更为常见。然而，在核心早期发育基因和转录因子中，母源转录表现出稳定化选择和定向选择并存的模式，而合子转录则主要处于稳定化选择之下。许多热休克基因在热带与温带胚胎之间表现出定向选择模式，这与局部适应相一致。此外，piRNA通路基因中的定向选择表明生殖系防御在胚胎发生过程中可能发挥作用。总体而言，尽管我们的数据支持核心发育网络受稳定化选择约束这一经典观点，但全基因组范围内定向选择的普遍存在凸显了多样化选择对早期发育进化具有显著且此前未被充分认识的重要贡献。

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黑腹果蝇胚胎中母源性与合子基因表达所受自然选择的模式

Thomas S. O'Leary Brent L. Lockwood

doi： https://doi.org/10.64898/2026.05.29.728885

Thomas S. O'Leary 佛蒙特大学 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY-ND 4.0 国际许可协议公开提供。

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发表于 2026 年 5 月 31 日。

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黑腹果蝇胚胎中母源性与合子基因表达所受自然选择的模式 Thomas S. O'Leary，Brent L. Lockwood bioRxiv 2026.05.29.728885； doi： https://doi.org/10.64898/2026.05.29.728885

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黑腹果蝇胚胎中母源性与合子基因表达所受自然选择的模式 Thomas S. O'Leary，Brent L. Lockwood bioRxiv 2026.05.29.728885； doi： https://doi.org/10.64898/2026.05.29.728885

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.29.728885v1?rss=1

🏷️ 果蝇胚胎 母源表达 合子表达 自然选择 RNA测序 发育进化